Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE0

CASKIN2, Caskin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKIN2Q8WXE0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CASKIN2Q8WXE0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CASKIN2Q8WXE0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CASKIN2Q8WXE0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CASKIN2Q8WXE0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CASKIN2Q8WXE0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CASKIN2Q8WXE0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CASKIN2Q8WXE0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CASKIN2Q8WXE0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CASKIN2Q8WXE0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CASKIN2Q8WXE0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CASKIN2Q8WXE0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CASKIN2Q8WXE0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CASKIN2Q8WXE0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CASKIN2Q8WXE0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CASKIN2Q8WXE0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CASKIN2Q8WXE0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CASKIN2Q8WXE0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CASKIN2Q8WXE0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CASKIN2Q8WXE0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CASKIN2Q8WXE0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CASKIN2Q8WXE0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CASKIN2Q8WXE0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CASKIN2Q8WXE0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CASKIN2Q8WXE0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CASKIN2Q8WXE0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CASKIN2Q8WXE0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CASKIN2Q8WXE0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CASKIN2Q8WXE0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CASKIN2Q8WXE0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CASKIN2Q8WXE0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CASKIN2Q8WXE0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CASKIN2Q8WXE0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CASKIN2Q8WXE0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CASKIN2Q8WXE0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CASKIN2Q8WXE0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CASKIN2Q8WXE0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CASKIN2Q8WXE0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CASKIN2Q8WXE0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CASKIN2Q8WXE0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CASKIN2Q8WXE0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CASKIN2Q8WXE0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CASKIN2Q8WXE0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CASKIN2Q8WXE0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CASKIN2Q8WXE0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CASKIN2Q8WXE0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CASKIN2Q8WXE0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CASKIN2Q8WXE0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CASKIN2Q8WXE0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CASKIN2Q8WXE0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CASKIN2Q8WXE0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CASKIN2Q8WXE0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CASKIN2Q8WXE0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CASKIN2Q8WXE0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CASKIN2Q8WXE0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CASKIN2Q8WXE0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CASKIN2Q8WXE0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CASKIN2Q8WXE0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CASKIN2Q8WXE0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CASKIN2Q8WXE0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CASKIN2Q8WXE0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CASKIN2Q8WXE0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CASKIN2Q8WXE0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CASKIN2Q8WXE0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CASKIN2Q8WXE0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CASKIN2Q8WXE0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CASKIN2Q8WXE0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CASKIN2Q8WXE0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CASKIN2Q8WXE0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CASKIN2Q8WXE0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CASKIN2Q8WXE0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CASKIN2Q8WXE0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CASKIN2Q8WXE0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CASKIN2Q8WXE0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CASKIN2Q8WXE0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CASKIN2Q8WXE0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
CASKIN2Q8WXE0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CASKIN2Q8WXE0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CASKIN2Q8WXE0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CASKIN2Q8WXE0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CASKIN2Q8WXE0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CASKIN2Q8WXE0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CASKIN2Q8WXE0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CASKIN2Q8WXE0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CASKIN2Q8WXE0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CASKIN2Q8WXE0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CASKIN2Q8WXE0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CASKIN2Q8WXE0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CASKIN2Q8WXE0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CASKIN2Q8WXE0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CASKIN2Q8WXE0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CASKIN2Q8WXE0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CASKIN2Q8WXE0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CASKIN2Q8WXE0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CASKIN2Q8WXE0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CASKIN2Q8WXE0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CASKIN2Q8WXE0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CASKIN2Q8WXE0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CASKIN2Q8WXE0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CASKIN2Q8WXE0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms