Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDB4

MGARP, Protein MGARP, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGARPQ8TDB4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
MGARPQ8TDB4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MGARPQ8TDB4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MGARPQ8TDB4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MGARPQ8TDB4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MGARPQ8TDB4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MGARPQ8TDB4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MGARPQ8TDB4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MGARPQ8TDB4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MGARPQ8TDB4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MGARPQ8TDB4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MGARPQ8TDB4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MGARPQ8TDB4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MGARPQ8TDB4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MGARPQ8TDB4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MGARPQ8TDB4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MGARPQ8TDB4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MGARPQ8TDB4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MGARPQ8TDB4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
MGARPQ8TDB4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
MGARPQ8TDB4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
MGARPQ8TDB4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MGARPQ8TDB4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MGARPQ8TDB4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MGARPQ8TDB4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MGARPQ8TDB4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MGARPQ8TDB4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MGARPQ8TDB4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MGARPQ8TDB4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MGARPQ8TDB4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MGARPQ8TDB4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MGARPQ8TDB4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MGARPQ8TDB4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MGARPQ8TDB4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MGARPQ8TDB4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MGARPQ8TDB4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MGARPQ8TDB4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MGARPQ8TDB4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MGARPQ8TDB4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MGARPQ8TDB4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MGARPQ8TDB4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MGARPQ8TDB4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MGARPQ8TDB4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MGARPQ8TDB4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MGARPQ8TDB4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MGARPQ8TDB4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MGARPQ8TDB4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MGARPQ8TDB4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MGARPQ8TDB4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MGARPQ8TDB4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MGARPQ8TDB4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MGARPQ8TDB4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MGARPQ8TDB4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MGARPQ8TDB4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MGARPQ8TDB4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MGARPQ8TDB4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MGARPQ8TDB4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MGARPQ8TDB4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MGARPQ8TDB4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MGARPQ8TDB4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MGARPQ8TDB4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MGARPQ8TDB4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MGARPQ8TDB4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MGARPQ8TDB4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MGARPQ8TDB4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MGARPQ8TDB4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MGARPQ8TDB4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MGARPQ8TDB4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MGARPQ8TDB4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MGARPQ8TDB4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MGARPQ8TDB4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MGARPQ8TDB4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MGARPQ8TDB4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MGARPQ8TDB4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MGARPQ8TDB4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MGARPQ8TDB4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MGARPQ8TDB4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MGARPQ8TDB4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
MGARPQ8TDB4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MGARPQ8TDB4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MGARPQ8TDB4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MGARPQ8TDB4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MGARPQ8TDB4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MGARPQ8TDB4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MGARPQ8TDB4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MGARPQ8TDB4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MGARPQ8TDB4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
MGARPQ8TDB4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MGARPQ8TDB4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MGARPQ8TDB4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MGARPQ8TDB4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MGARPQ8TDB4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MGARPQ8TDB4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MGARPQ8TDB4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MGARPQ8TDB4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MGARPQ8TDB4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MGARPQ8TDB4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MGARPQ8TDB4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MGARPQ8TDB4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MGARPQ8TDB4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms