Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDX1

PSD4, PH and SEC7 domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,056 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSD4Q8NDX1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSD4Q8NDX1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSD4Q8NDX1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSD4Q8NDX1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSD4Q8NDX1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSD4Q8NDX1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSD4Q8NDX1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSD4Q8NDX1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSD4Q8NDX1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSD4Q8NDX1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSD4Q8NDX1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSD4Q8NDX1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSD4Q8NDX1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSD4Q8NDX1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSD4Q8NDX1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSD4Q8NDX1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSD4Q8NDX1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSD4Q8NDX1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSD4Q8NDX1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSD4Q8NDX1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSD4Q8NDX1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSD4Q8NDX1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSD4Q8NDX1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSD4Q8NDX1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSD4Q8NDX1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSD4Q8NDX1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSD4Q8NDX1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PSD4Q8NDX1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSD4Q8NDX1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSD4Q8NDX1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSD4Q8NDX1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PSD4Q8NDX1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSD4Q8NDX1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSD4Q8NDX1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSD4Q8NDX1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSD4Q8NDX1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSD4Q8NDX1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSD4Q8NDX1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PSD4Q8NDX1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSD4Q8NDX1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSD4Q8NDX1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSD4Q8NDX1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSD4Q8NDX1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSD4Q8NDX1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSD4Q8NDX1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSD4Q8NDX1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSD4Q8NDX1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PSD4Q8NDX1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSD4Q8NDX1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSD4Q8NDX1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSD4Q8NDX1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSD4Q8NDX1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSD4Q8NDX1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSD4Q8NDX1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSD4Q8NDX1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSD4Q8NDX1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSD4Q8NDX1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSD4Q8NDX1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSD4Q8NDX1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSD4Q8NDX1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSD4Q8NDX1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSD4Q8NDX1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSD4Q8NDX1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSD4Q8NDX1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSD4Q8NDX1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSD4Q8NDX1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSD4Q8NDX1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSD4Q8NDX1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSD4Q8NDX1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSD4Q8NDX1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSD4Q8NDX1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PSD4Q8NDX1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSD4Q8NDX1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSD4Q8NDX1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSD4Q8NDX1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSD4Q8NDX1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSD4Q8NDX1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSD4Q8NDX1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSD4Q8NDX1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSD4Q8NDX1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PSD4Q8NDX1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSD4Q8NDX1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PSD4Q8NDX1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSD4Q8NDX1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSD4Q8NDX1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSD4Q8NDX1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSD4Q8NDX1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSD4Q8NDX1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSD4Q8NDX1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSD4Q8NDX1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSD4Q8NDX1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSD4Q8NDX1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSD4Q8NDX1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSD4Q8NDX1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSD4Q8NDX1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSD4Q8NDX1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSD4Q8NDX1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSD4Q8NDX1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSD4Q8NDX1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSD4Q8NDX1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms