Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5G0

SMIM20, Small integral membrane protein 20, humanhuman

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Length 67 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20Q8N5G0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM20Q8N5G0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM20Q8N5G0 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM20Q8N5G0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM20Q8N5G0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM20Q8N5G0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM20Q8N5G0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM20Q8N5G0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM20Q8N5G0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM20Q8N5G0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM20Q8N5G0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM20Q8N5G0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM20Q8N5G0 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM20Q8N5G0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM20Q8N5G0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM20Q8N5G0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM20Q8N5G0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM20Q8N5G0 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM20Q8N5G0 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM20Q8N5G0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM20Q8N5G0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM20Q8N5G0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM20Q8N5G0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM20Q8N5G0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM20Q8N5G0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM20Q8N5G0 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM20Q8N5G0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM20Q8N5G0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM20Q8N5G0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM20Q8N5G0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM20Q8N5G0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM20Q8N5G0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM20Q8N5G0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM20Q8N5G0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM20Q8N5G0 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM20Q8N5G0 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM20Q8N5G0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM20Q8N5G0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM20Q8N5G0 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM20Q8N5G0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM20Q8N5G0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM20Q8N5G0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM20Q8N5G0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM20Q8N5G0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM20Q8N5G0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMIM20Q8N5G0 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMIM20Q8N5G0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMIM20Q8N5G0 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMIM20Q8N5G0 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMIM20Q8N5G0 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMIM20Q8N5G0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMIM20Q8N5G0 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMIM20Q8N5G0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM20Q8N5G0 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM20Q8N5G0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM20Q8N5G0 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM20Q8N5G0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM20Q8N5G0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM20Q8N5G0 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM20Q8N5G0 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM20Q8N5G0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM20Q8N5G0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM20Q8N5G0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM20Q8N5G0 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM20Q8N5G0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM20Q8N5G0 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM20Q8N5G0 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM20Q8N5G0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM20Q8N5G0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM20Q8N5G0 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM20Q8N5G0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM20Q8N5G0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM20Q8N5G0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM20Q8N5G0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM20Q8N5G0 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMIM20Q8N5G0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMIM20Q8N5G0 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMIM20Q8N5G0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMIM20Q8N5G0 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SMIM20Q8N5G0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SMIM20Q8N5G0 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SMIM20Q8N5G0 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMIM20Q8N5G0 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMIM20Q8N5G0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMIM20Q8N5G0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMIM20Q8N5G0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMIM20Q8N5G0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMIM20Q8N5G0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMIM20Q8N5G0 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMIM20Q8N5G0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SMIM20Q8N5G0 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMIM20Q8N5G0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMIM20Q8N5G0 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMIM20Q8N5G0 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM20Q8N5G0 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM20Q8N5G0 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM20Q8N5G0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM20Q8N5G0 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM20Q8N5G0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM20Q8N5G0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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