Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVE0

CROCCP3, Putative ciliary rootlet coiled-coil protein-like 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROCCP3Q8IVE0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CROCCP3Q8IVE0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CROCCP3Q8IVE0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CROCCP3Q8IVE0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CROCCP3Q8IVE0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CROCCP3Q8IVE0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CROCCP3Q8IVE0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CROCCP3Q8IVE0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CROCCP3Q8IVE0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CROCCP3Q8IVE0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CROCCP3Q8IVE0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CROCCP3Q8IVE0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CROCCP3Q8IVE0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CROCCP3Q8IVE0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CROCCP3Q8IVE0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CROCCP3Q8IVE0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CROCCP3Q8IVE0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CROCCP3Q8IVE0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CROCCP3Q8IVE0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CROCCP3Q8IVE0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CROCCP3Q8IVE0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CROCCP3Q8IVE0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CROCCP3Q8IVE0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CROCCP3Q8IVE0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CROCCP3Q8IVE0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CROCCP3Q8IVE0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CROCCP3Q8IVE0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CROCCP3Q8IVE0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CROCCP3Q8IVE0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CROCCP3Q8IVE0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CROCCP3Q8IVE0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CROCCP3Q8IVE0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CROCCP3Q8IVE0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CROCCP3Q8IVE0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CROCCP3Q8IVE0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CROCCP3Q8IVE0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CROCCP3Q8IVE0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CROCCP3Q8IVE0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CROCCP3Q8IVE0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CROCCP3Q8IVE0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CROCCP3Q8IVE0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CROCCP3Q8IVE0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CROCCP3Q8IVE0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CROCCP3Q8IVE0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CROCCP3Q8IVE0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CROCCP3Q8IVE0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CROCCP3Q8IVE0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CROCCP3Q8IVE0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CROCCP3Q8IVE0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CROCCP3Q8IVE0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CROCCP3Q8IVE0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CROCCP3Q8IVE0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CROCCP3Q8IVE0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CROCCP3Q8IVE0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CROCCP3Q8IVE0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CROCCP3Q8IVE0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CROCCP3Q8IVE0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CROCCP3Q8IVE0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CROCCP3Q8IVE0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CROCCP3Q8IVE0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CROCCP3Q8IVE0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CROCCP3Q8IVE0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CROCCP3Q8IVE0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
CROCCP3Q8IVE0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CROCCP3Q8IVE0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CROCCP3Q8IVE0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CROCCP3Q8IVE0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CROCCP3Q8IVE0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CROCCP3Q8IVE0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CROCCP3Q8IVE0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CROCCP3Q8IVE0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CROCCP3Q8IVE0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CROCCP3Q8IVE0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CROCCP3Q8IVE0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CROCCP3Q8IVE0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CROCCP3Q8IVE0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CROCCP3Q8IVE0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CROCCP3Q8IVE0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CROCCP3Q8IVE0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CROCCP3Q8IVE0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CROCCP3Q8IVE0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CROCCP3Q8IVE0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CROCCP3Q8IVE0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CROCCP3Q8IVE0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CROCCP3Q8IVE0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CROCCP3Q8IVE0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CROCCP3Q8IVE0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CROCCP3Q8IVE0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CROCCP3Q8IVE0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CROCCP3Q8IVE0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CROCCP3Q8IVE0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CROCCP3Q8IVE0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CROCCP3Q8IVE0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CROCCP3Q8IVE0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CROCCP3Q8IVE0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CROCCP3Q8IVE0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CROCCP3Q8IVE0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CROCCP3Q8IVE0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CROCCP3Q8IVE0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CROCCP3Q8IVE0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms