Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVE0

CROCCP3, Putative ciliary rootlet coiled-coil protein-like 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROCCP3Q8IVE0 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CROCCP3Q8IVE0 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
CROCCP3Q8IVE0 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.68■■■□□ 2.5
CROCCP3Q8IVE0 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CROCCP3Q8IVE0 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CROCCP3Q8IVE0 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CROCCP3Q8IVE0 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CROCCP3Q8IVE0 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CROCCP3Q8IVE0 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CROCCP3Q8IVE0 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CROCCP3Q8IVE0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CROCCP3Q8IVE0 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CROCCP3Q8IVE0 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CROCCP3Q8IVE0 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CROCCP3Q8IVE0 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CROCCP3Q8IVE0 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CROCCP3Q8IVE0 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CROCCP3Q8IVE0 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CROCCP3Q8IVE0 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CROCCP3Q8IVE0 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CROCCP3Q8IVE0 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CROCCP3Q8IVE0 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CROCCP3Q8IVE0 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CROCCP3Q8IVE0 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CROCCP3Q8IVE0 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CROCCP3Q8IVE0 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CROCCP3Q8IVE0 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CROCCP3Q8IVE0 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CROCCP3Q8IVE0 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CROCCP3Q8IVE0 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CROCCP3Q8IVE0 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CROCCP3Q8IVE0 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CROCCP3Q8IVE0 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CROCCP3Q8IVE0 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CROCCP3Q8IVE0 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CROCCP3Q8IVE0 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CROCCP3Q8IVE0 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CROCCP3Q8IVE0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CROCCP3Q8IVE0 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CROCCP3Q8IVE0 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CROCCP3Q8IVE0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CROCCP3Q8IVE0 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CROCCP3Q8IVE0 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CROCCP3Q8IVE0 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CROCCP3Q8IVE0 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CROCCP3Q8IVE0 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CROCCP3Q8IVE0 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CROCCP3Q8IVE0 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CROCCP3Q8IVE0 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CROCCP3Q8IVE0 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CROCCP3Q8IVE0 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CROCCP3Q8IVE0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CROCCP3Q8IVE0 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CROCCP3Q8IVE0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CROCCP3Q8IVE0 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CROCCP3Q8IVE0 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CROCCP3Q8IVE0 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CROCCP3Q8IVE0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CROCCP3Q8IVE0 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CROCCP3Q8IVE0 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CROCCP3Q8IVE0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CROCCP3Q8IVE0 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CROCCP3Q8IVE0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CROCCP3Q8IVE0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CROCCP3Q8IVE0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CROCCP3Q8IVE0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CROCCP3Q8IVE0 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CROCCP3Q8IVE0 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CROCCP3Q8IVE0 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CROCCP3Q8IVE0 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CROCCP3Q8IVE0 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CROCCP3Q8IVE0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CROCCP3Q8IVE0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CROCCP3Q8IVE0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CROCCP3Q8IVE0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CROCCP3Q8IVE0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CROCCP3Q8IVE0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CROCCP3Q8IVE0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CROCCP3Q8IVE0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CROCCP3Q8IVE0 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CROCCP3Q8IVE0 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CROCCP3Q8IVE0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CROCCP3Q8IVE0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CROCCP3Q8IVE0 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CROCCP3Q8IVE0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CROCCP3Q8IVE0 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CROCCP3Q8IVE0 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CROCCP3Q8IVE0 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CROCCP3Q8IVE0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CROCCP3Q8IVE0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CROCCP3Q8IVE0 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CROCCP3Q8IVE0 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CROCCP3Q8IVE0 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CROCCP3Q8IVE0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CROCCP3Q8IVE0 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CROCCP3Q8IVE0 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CROCCP3Q8IVE0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CROCCP3Q8IVE0 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CROCCP3Q8IVE0 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CROCCP3Q8IVE0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms