Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI8

CRLF3, Cytokine receptor-like factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRLF3Q8IUI8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CRLF3Q8IUI8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CRLF3Q8IUI8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CRLF3Q8IUI8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CRLF3Q8IUI8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRLF3Q8IUI8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRLF3Q8IUI8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRLF3Q8IUI8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRLF3Q8IUI8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRLF3Q8IUI8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRLF3Q8IUI8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CRLF3Q8IUI8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CRLF3Q8IUI8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CRLF3Q8IUI8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CRLF3Q8IUI8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CRLF3Q8IUI8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CRLF3Q8IUI8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CRLF3Q8IUI8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CRLF3Q8IUI8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CRLF3Q8IUI8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CRLF3Q8IUI8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CRLF3Q8IUI8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CRLF3Q8IUI8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CRLF3Q8IUI8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CRLF3Q8IUI8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CRLF3Q8IUI8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CRLF3Q8IUI8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CRLF3Q8IUI8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CRLF3Q8IUI8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CRLF3Q8IUI8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CRLF3Q8IUI8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CRLF3Q8IUI8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CRLF3Q8IUI8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CRLF3Q8IUI8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CRLF3Q8IUI8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CRLF3Q8IUI8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CRLF3Q8IUI8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CRLF3Q8IUI8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CRLF3Q8IUI8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CRLF3Q8IUI8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CRLF3Q8IUI8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CRLF3Q8IUI8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CRLF3Q8IUI8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CRLF3Q8IUI8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CRLF3Q8IUI8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CRLF3Q8IUI8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CRLF3Q8IUI8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CRLF3Q8IUI8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CRLF3Q8IUI8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CRLF3Q8IUI8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CRLF3Q8IUI8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CRLF3Q8IUI8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CRLF3Q8IUI8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CRLF3Q8IUI8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CRLF3Q8IUI8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CRLF3Q8IUI8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CRLF3Q8IUI8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CRLF3Q8IUI8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CRLF3Q8IUI8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CRLF3Q8IUI8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CRLF3Q8IUI8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CRLF3Q8IUI8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CRLF3Q8IUI8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CRLF3Q8IUI8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CRLF3Q8IUI8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CRLF3Q8IUI8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CRLF3Q8IUI8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRLF3Q8IUI8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRLF3Q8IUI8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRLF3Q8IUI8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRLF3Q8IUI8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRLF3Q8IUI8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRLF3Q8IUI8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRLF3Q8IUI8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRLF3Q8IUI8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRLF3Q8IUI8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRLF3Q8IUI8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRLF3Q8IUI8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRLF3Q8IUI8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRLF3Q8IUI8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRLF3Q8IUI8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRLF3Q8IUI8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CRLF3Q8IUI8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRLF3Q8IUI8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRLF3Q8IUI8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRLF3Q8IUI8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRLF3Q8IUI8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRLF3Q8IUI8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRLF3Q8IUI8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRLF3Q8IUI8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRLF3Q8IUI8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRLF3Q8IUI8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRLF3Q8IUI8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CRLF3Q8IUI8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRLF3Q8IUI8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRLF3Q8IUI8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRLF3Q8IUI8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CRLF3Q8IUI8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CRLF3Q8IUI8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CRLF3Q8IUI8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms