Protein–RNA interactions for Protein: Q86YD5

LDLRAD3, Low-density lipoprotein receptor class A domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAD3Q86YD5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LDLRAD3Q86YD5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LDLRAD3Q86YD5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LDLRAD3Q86YD5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LDLRAD3Q86YD5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
LDLRAD3Q86YD5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LDLRAD3Q86YD5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LDLRAD3Q86YD5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LDLRAD3Q86YD5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LDLRAD3Q86YD5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LDLRAD3Q86YD5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LDLRAD3Q86YD5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LDLRAD3Q86YD5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LDLRAD3Q86YD5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LDLRAD3Q86YD5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LDLRAD3Q86YD5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LDLRAD3Q86YD5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LDLRAD3Q86YD5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LDLRAD3Q86YD5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LDLRAD3Q86YD5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LDLRAD3Q86YD5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LDLRAD3Q86YD5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LDLRAD3Q86YD5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LDLRAD3Q86YD5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LDLRAD3Q86YD5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LDLRAD3Q86YD5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LDLRAD3Q86YD5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LDLRAD3Q86YD5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LDLRAD3Q86YD5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LDLRAD3Q86YD5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LDLRAD3Q86YD5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LDLRAD3Q86YD5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LDLRAD3Q86YD5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LDLRAD3Q86YD5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LDLRAD3Q86YD5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LDLRAD3Q86YD5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LDLRAD3Q86YD5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LDLRAD3Q86YD5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LDLRAD3Q86YD5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LDLRAD3Q86YD5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LDLRAD3Q86YD5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
LDLRAD3Q86YD5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LDLRAD3Q86YD5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LDLRAD3Q86YD5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LDLRAD3Q86YD5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LDLRAD3Q86YD5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LDLRAD3Q86YD5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LDLRAD3Q86YD5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LDLRAD3Q86YD5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LDLRAD3Q86YD5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LDLRAD3Q86YD5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LDLRAD3Q86YD5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LDLRAD3Q86YD5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LDLRAD3Q86YD5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LDLRAD3Q86YD5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LDLRAD3Q86YD5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LDLRAD3Q86YD5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LDLRAD3Q86YD5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LDLRAD3Q86YD5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LDLRAD3Q86YD5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LDLRAD3Q86YD5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LDLRAD3Q86YD5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LDLRAD3Q86YD5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LDLRAD3Q86YD5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LDLRAD3Q86YD5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
LDLRAD3Q86YD5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
LDLRAD3Q86YD5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LDLRAD3Q86YD5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LDLRAD3Q86YD5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LDLRAD3Q86YD5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LDLRAD3Q86YD5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LDLRAD3Q86YD5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LDLRAD3Q86YD5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LDLRAD3Q86YD5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LDLRAD3Q86YD5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LDLRAD3Q86YD5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LDLRAD3Q86YD5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LDLRAD3Q86YD5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LDLRAD3Q86YD5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LDLRAD3Q86YD5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LDLRAD3Q86YD5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LDLRAD3Q86YD5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LDLRAD3Q86YD5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LDLRAD3Q86YD5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LDLRAD3Q86YD5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LDLRAD3Q86YD5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LDLRAD3Q86YD5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LDLRAD3Q86YD5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LDLRAD3Q86YD5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LDLRAD3Q86YD5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LDLRAD3Q86YD5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LDLRAD3Q86YD5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LDLRAD3Q86YD5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
LDLRAD3Q86YD5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
LDLRAD3Q86YD5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
LDLRAD3Q86YD5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LDLRAD3Q86YD5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LDLRAD3Q86YD5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LDLRAD3Q86YD5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LDLRAD3Q86YD5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms