Protein–RNA interactions for Protein: Q6W349

LINC00575, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00575, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00575Q6W349 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00575Q6W349 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00575Q6W349 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00575Q6W349 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00575Q6W349 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00575Q6W349 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00575Q6W349 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00575Q6W349 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00575Q6W349 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00575Q6W349 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00575Q6W349 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00575Q6W349 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00575Q6W349 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00575Q6W349 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00575Q6W349 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00575Q6W349 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00575Q6W349 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00575Q6W349 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00575Q6W349 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00575Q6W349 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00575Q6W349 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00575Q6W349 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00575Q6W349 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00575Q6W349 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00575Q6W349 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00575Q6W349 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00575Q6W349 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00575Q6W349 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00575Q6W349 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00575Q6W349 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00575Q6W349 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00575Q6W349 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00575Q6W349 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00575Q6W349 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LINC00575Q6W349 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00575Q6W349 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00575Q6W349 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00575Q6W349 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00575Q6W349 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00575Q6W349 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00575Q6W349 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00575Q6W349 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00575Q6W349 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00575Q6W349 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00575Q6W349 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00575Q6W349 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00575Q6W349 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00575Q6W349 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00575Q6W349 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00575Q6W349 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00575Q6W349 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00575Q6W349 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00575Q6W349 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00575Q6W349 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00575Q6W349 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00575Q6W349 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00575Q6W349 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00575Q6W349 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00575Q6W349 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00575Q6W349 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00575Q6W349 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00575Q6W349 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00575Q6W349 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00575Q6W349 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00575Q6W349 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00575Q6W349 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00575Q6W349 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00575Q6W349 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00575Q6W349 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00575Q6W349 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00575Q6W349 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00575Q6W349 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00575Q6W349 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00575Q6W349 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00575Q6W349 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00575Q6W349 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00575Q6W349 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00575Q6W349 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00575Q6W349 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00575Q6W349 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00575Q6W349 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00575Q6W349 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00575Q6W349 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00575Q6W349 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00575Q6W349 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00575Q6W349 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00575Q6W349 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00575Q6W349 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00575Q6W349 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00575Q6W349 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00575Q6W349 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00575Q6W349 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00575Q6W349 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00575Q6W349 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00575Q6W349 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00575Q6W349 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00575Q6W349 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00575Q6W349 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00575Q6W349 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00575Q6W349 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms