Protein–RNA interactions for Protein: Q6P474

PDXDC2P, Putative pyridoxal-dependent decarboxylase domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDXDC2PQ6P474 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PDXDC2PQ6P474 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PDXDC2PQ6P474 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PDXDC2PQ6P474 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PDXDC2PQ6P474 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PDXDC2PQ6P474 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PDXDC2PQ6P474 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PDXDC2PQ6P474 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PDXDC2PQ6P474 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PDXDC2PQ6P474 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PDXDC2PQ6P474 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PDXDC2PQ6P474 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PDXDC2PQ6P474 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PDXDC2PQ6P474 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PDXDC2PQ6P474 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PDXDC2PQ6P474 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PDXDC2PQ6P474 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
PDXDC2PQ6P474 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PDXDC2PQ6P474 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PDXDC2PQ6P474 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PDXDC2PQ6P474 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
PDXDC2PQ6P474 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PDXDC2PQ6P474 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PDXDC2PQ6P474 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PDXDC2PQ6P474 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PDXDC2PQ6P474 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PDXDC2PQ6P474 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PDXDC2PQ6P474 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PDXDC2PQ6P474 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
PDXDC2PQ6P474 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PDXDC2PQ6P474 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PDXDC2PQ6P474 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PDXDC2PQ6P474 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PDXDC2PQ6P474 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PDXDC2PQ6P474 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PDXDC2PQ6P474 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PDXDC2PQ6P474 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PDXDC2PQ6P474 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PDXDC2PQ6P474 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PDXDC2PQ6P474 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PDXDC2PQ6P474 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PDXDC2PQ6P474 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PDXDC2PQ6P474 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
PDXDC2PQ6P474 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PDXDC2PQ6P474 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PDXDC2PQ6P474 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PDXDC2PQ6P474 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PDXDC2PQ6P474 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PDXDC2PQ6P474 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PDXDC2PQ6P474 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PDXDC2PQ6P474 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
PDXDC2PQ6P474 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PDXDC2PQ6P474 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PDXDC2PQ6P474 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PDXDC2PQ6P474 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PDXDC2PQ6P474 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PDXDC2PQ6P474 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
PDXDC2PQ6P474 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PDXDC2PQ6P474 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PDXDC2PQ6P474 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PDXDC2PQ6P474 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PDXDC2PQ6P474 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PDXDC2PQ6P474 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PDXDC2PQ6P474 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PDXDC2PQ6P474 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PDXDC2PQ6P474 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PDXDC2PQ6P474 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PDXDC2PQ6P474 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PDXDC2PQ6P474 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PDXDC2PQ6P474 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PDXDC2PQ6P474 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PDXDC2PQ6P474 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PDXDC2PQ6P474 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PDXDC2PQ6P474 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PDXDC2PQ6P474 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PDXDC2PQ6P474 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PDXDC2PQ6P474 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PDXDC2PQ6P474 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PDXDC2PQ6P474 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PDXDC2PQ6P474 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PDXDC2PQ6P474 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PDXDC2PQ6P474 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PDXDC2PQ6P474 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PDXDC2PQ6P474 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PDXDC2PQ6P474 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PDXDC2PQ6P474 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PDXDC2PQ6P474 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PDXDC2PQ6P474 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PDXDC2PQ6P474 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PDXDC2PQ6P474 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PDXDC2PQ6P474 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PDXDC2PQ6P474 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PDXDC2PQ6P474 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PDXDC2PQ6P474 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PDXDC2PQ6P474 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PDXDC2PQ6P474 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PDXDC2PQ6P474 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PDXDC2PQ6P474 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
PDXDC2PQ6P474 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PDXDC2PQ6P474 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms