Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTE0

EEF1A1P5, Putative elongation factor 1-alpha-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1A1P5Q5VTE0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EEF1A1P5Q5VTE0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EEF1A1P5Q5VTE0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EEF1A1P5Q5VTE0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EEF1A1P5Q5VTE0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EEF1A1P5Q5VTE0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EEF1A1P5Q5VTE0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EEF1A1P5Q5VTE0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EEF1A1P5Q5VTE0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EEF1A1P5Q5VTE0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EEF1A1P5Q5VTE0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EEF1A1P5Q5VTE0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EEF1A1P5Q5VTE0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EEF1A1P5Q5VTE0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
EEF1A1P5Q5VTE0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EEF1A1P5Q5VTE0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EEF1A1P5Q5VTE0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EEF1A1P5Q5VTE0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
EEF1A1P5Q5VTE0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EEF1A1P5Q5VTE0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EEF1A1P5Q5VTE0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EEF1A1P5Q5VTE0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EEF1A1P5Q5VTE0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EEF1A1P5Q5VTE0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EEF1A1P5Q5VTE0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EEF1A1P5Q5VTE0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EEF1A1P5Q5VTE0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EEF1A1P5Q5VTE0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EEF1A1P5Q5VTE0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EEF1A1P5Q5VTE0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EEF1A1P5Q5VTE0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EEF1A1P5Q5VTE0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
EEF1A1P5Q5VTE0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EEF1A1P5Q5VTE0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EEF1A1P5Q5VTE0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EEF1A1P5Q5VTE0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EEF1A1P5Q5VTE0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EEF1A1P5Q5VTE0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EEF1A1P5Q5VTE0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EEF1A1P5Q5VTE0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EEF1A1P5Q5VTE0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EEF1A1P5Q5VTE0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EEF1A1P5Q5VTE0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EEF1A1P5Q5VTE0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EEF1A1P5Q5VTE0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EEF1A1P5Q5VTE0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EEF1A1P5Q5VTE0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EEF1A1P5Q5VTE0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EEF1A1P5Q5VTE0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EEF1A1P5Q5VTE0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EEF1A1P5Q5VTE0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EEF1A1P5Q5VTE0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EEF1A1P5Q5VTE0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EEF1A1P5Q5VTE0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EEF1A1P5Q5VTE0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
EEF1A1P5Q5VTE0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EEF1A1P5Q5VTE0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EEF1A1P5Q5VTE0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EEF1A1P5Q5VTE0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EEF1A1P5Q5VTE0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EEF1A1P5Q5VTE0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EEF1A1P5Q5VTE0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EEF1A1P5Q5VTE0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EEF1A1P5Q5VTE0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EEF1A1P5Q5VTE0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EEF1A1P5Q5VTE0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
EEF1A1P5Q5VTE0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
EEF1A1P5Q5VTE0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EEF1A1P5Q5VTE0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EEF1A1P5Q5VTE0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EEF1A1P5Q5VTE0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EEF1A1P5Q5VTE0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EEF1A1P5Q5VTE0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EEF1A1P5Q5VTE0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EEF1A1P5Q5VTE0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EEF1A1P5Q5VTE0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EEF1A1P5Q5VTE0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
EEF1A1P5Q5VTE0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EEF1A1P5Q5VTE0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EEF1A1P5Q5VTE0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EEF1A1P5Q5VTE0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EEF1A1P5Q5VTE0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EEF1A1P5Q5VTE0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EEF1A1P5Q5VTE0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EEF1A1P5Q5VTE0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EEF1A1P5Q5VTE0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EEF1A1P5Q5VTE0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EEF1A1P5Q5VTE0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EEF1A1P5Q5VTE0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EEF1A1P5Q5VTE0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EEF1A1P5Q5VTE0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EEF1A1P5Q5VTE0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EEF1A1P5Q5VTE0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EEF1A1P5Q5VTE0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EEF1A1P5Q5VTE0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EEF1A1P5Q5VTE0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EEF1A1P5Q5VTE0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EEF1A1P5Q5VTE0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
EEF1A1P5Q5VTE0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EEF1A1P5Q5VTE0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms