Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT06

CEP350, Centrosome-associated protein 350, humanhuman

Predictions only

Length 3,117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP350Q5VT06 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CEP350Q5VT06 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CEP350Q5VT06 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CEP350Q5VT06 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CEP350Q5VT06 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CEP350Q5VT06 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CEP350Q5VT06 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CEP350Q5VT06 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CEP350Q5VT06 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
CEP350Q5VT06 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
CEP350Q5VT06 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
CEP350Q5VT06 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
CEP350Q5VT06 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
CEP350Q5VT06 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC30.45■■■□□ 2.46
CEP350Q5VT06 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CEP350Q5VT06 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CEP350Q5VT06 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
CEP350Q5VT06 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CEP350Q5VT06 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CEP350Q5VT06 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
CEP350Q5VT06 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CEP350Q5VT06 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
CEP350Q5VT06 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CEP350Q5VT06 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CEP350Q5VT06 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CEP350Q5VT06 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CEP350Q5VT06 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CEP350Q5VT06 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CEP350Q5VT06 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CEP350Q5VT06 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CEP350Q5VT06 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CEP350Q5VT06 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CEP350Q5VT06 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CEP350Q5VT06 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CEP350Q5VT06 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CEP350Q5VT06 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
CEP350Q5VT06 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
CEP350Q5VT06 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CEP350Q5VT06 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CEP350Q5VT06 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CEP350Q5VT06 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CEP350Q5VT06 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CEP350Q5VT06 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CEP350Q5VT06 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CEP350Q5VT06 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CEP350Q5VT06 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CEP350Q5VT06 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CEP350Q5VT06 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
CEP350Q5VT06 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CEP350Q5VT06 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CEP350Q5VT06 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
CEP350Q5VT06 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CEP350Q5VT06 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CEP350Q5VT06 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CEP350Q5VT06 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CEP350Q5VT06 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CEP350Q5VT06 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CEP350Q5VT06 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CEP350Q5VT06 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CEP350Q5VT06 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
CEP350Q5VT06 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CEP350Q5VT06 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
CEP350Q5VT06 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CEP350Q5VT06 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CEP350Q5VT06 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
CEP350Q5VT06 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CEP350Q5VT06 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CEP350Q5VT06 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CEP350Q5VT06 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CEP350Q5VT06 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CEP350Q5VT06 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CEP350Q5VT06 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CEP350Q5VT06 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CEP350Q5VT06 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CEP350Q5VT06 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CEP350Q5VT06 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CEP350Q5VT06 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CEP350Q5VT06 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
CEP350Q5VT06 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CEP350Q5VT06 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CEP350Q5VT06 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CEP350Q5VT06 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CEP350Q5VT06 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
CEP350Q5VT06 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CEP350Q5VT06 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CEP350Q5VT06 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
CEP350Q5VT06 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CEP350Q5VT06 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CEP350Q5VT06 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CEP350Q5VT06 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CEP350Q5VT06 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CEP350Q5VT06 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CEP350Q5VT06 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CEP350Q5VT06 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CEP350Q5VT06 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
CEP350Q5VT06 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CEP350Q5VT06 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CEP350Q5VT06 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CEP350Q5VT06 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CEP350Q5VT06 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms