Protein–RNA interactions for Protein: Q5BLP8

C4orf48, Neuropeptide-like protein C4orf48, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf48Q5BLP8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf48Q5BLP8 LIAS-205ENST00000509519 1005 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf48Q5BLP8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf48Q5BLP8 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf48Q5BLP8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf48Q5BLP8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf48Q5BLP8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf48Q5BLP8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf48Q5BLP8 AC010740.1-201ENST00000417035 684 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf48Q5BLP8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf48Q5BLP8 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf48Q5BLP8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf48Q5BLP8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf48Q5BLP8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf48Q5BLP8 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf48Q5BLP8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf48Q5BLP8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf48Q5BLP8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf48Q5BLP8 USP3-AS1-204ENST00000559861 620 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf48Q5BLP8 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf48Q5BLP8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf48Q5BLP8 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf48Q5BLP8 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf48Q5BLP8 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf48Q5BLP8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf48Q5BLP8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf48Q5BLP8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf48Q5BLP8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf48Q5BLP8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf48Q5BLP8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf48Q5BLP8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf48Q5BLP8 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf48Q5BLP8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf48Q5BLP8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf48Q5BLP8 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf48Q5BLP8 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf48Q5BLP8 OR2J1-201ENST00000377171 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf48Q5BLP8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf48Q5BLP8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf48Q5BLP8 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf48Q5BLP8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf48Q5BLP8 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf48Q5BLP8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf48Q5BLP8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf48Q5BLP8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf48Q5BLP8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf48Q5BLP8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf48Q5BLP8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf48Q5BLP8 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf48Q5BLP8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf48Q5BLP8 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf48Q5BLP8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf48Q5BLP8 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf48Q5BLP8 LINC00437-201ENST00000414161 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf48Q5BLP8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf48Q5BLP8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf48Q5BLP8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf48Q5BLP8 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C4orf48Q5BLP8 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C4orf48Q5BLP8 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C4orf48Q5BLP8 LINC01090-202ENST00000434418 560 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C4orf48Q5BLP8 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C4orf48Q5BLP8 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC15.08■□□□□ 0
C4orf48Q5BLP8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C4orf48Q5BLP8 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C4orf48Q5BLP8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C4orf48Q5BLP8 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C4orf48Q5BLP8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf48Q5BLP8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf48Q5BLP8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf48Q5BLP8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf48Q5BLP8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf48Q5BLP8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf48Q5BLP8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf48Q5BLP8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf48Q5BLP8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf48Q5BLP8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf48Q5BLP8 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf48Q5BLP8 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C4orf48Q5BLP8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C4orf48Q5BLP8 ADAM3B-201ENST00000569937 840 ntBASIC15.06■□□□□ 0
C4orf48Q5BLP8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C4orf48Q5BLP8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C4orf48Q5BLP8 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
C4orf48Q5BLP8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C4orf48Q5BLP8 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf48Q5BLP8 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf48Q5BLP8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf48Q5BLP8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf48Q5BLP8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf48Q5BLP8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf48Q5BLP8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf48Q5BLP8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC15.05■□□□□ -0
C4orf48Q5BLP8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf48Q5BLP8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf48Q5BLP8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf48Q5BLP8 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf48Q5BLP8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf48Q5BLP8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf48Q5BLP8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms