Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SDK2Q58EX2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SDK2Q58EX2 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SDK2Q58EX2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SDK2Q58EX2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SDK2Q58EX2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SDK2Q58EX2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SDK2Q58EX2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SDK2Q58EX2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SDK2Q58EX2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SDK2Q58EX2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SDK2Q58EX2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SDK2Q58EX2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SDK2Q58EX2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SDK2Q58EX2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SDK2Q58EX2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SDK2Q58EX2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SDK2Q58EX2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SDK2Q58EX2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SDK2Q58EX2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SDK2Q58EX2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SDK2Q58EX2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SDK2Q58EX2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SDK2Q58EX2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SDK2Q58EX2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SDK2Q58EX2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SDK2Q58EX2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SDK2Q58EX2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SDK2Q58EX2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SDK2Q58EX2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SDK2Q58EX2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SDK2Q58EX2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SDK2Q58EX2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SDK2Q58EX2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SDK2Q58EX2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SDK2Q58EX2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SDK2Q58EX2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SDK2Q58EX2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SDK2Q58EX2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SDK2Q58EX2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SDK2Q58EX2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SDK2Q58EX2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SDK2Q58EX2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SDK2Q58EX2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SDK2Q58EX2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SDK2Q58EX2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SDK2Q58EX2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SDK2Q58EX2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SDK2Q58EX2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SDK2Q58EX2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SDK2Q58EX2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SDK2Q58EX2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SDK2Q58EX2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SDK2Q58EX2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SDK2Q58EX2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SDK2Q58EX2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SDK2Q58EX2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SDK2Q58EX2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SDK2Q58EX2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SDK2Q58EX2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SDK2Q58EX2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SDK2Q58EX2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SDK2Q58EX2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SDK2Q58EX2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SDK2Q58EX2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SDK2Q58EX2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SDK2Q58EX2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SDK2Q58EX2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SDK2Q58EX2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SDK2Q58EX2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SDK2Q58EX2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SDK2Q58EX2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SDK2Q58EX2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SDK2Q58EX2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SDK2Q58EX2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SDK2Q58EX2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SDK2Q58EX2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SDK2Q58EX2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SDK2Q58EX2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SDK2Q58EX2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SDK2Q58EX2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SDK2Q58EX2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SDK2Q58EX2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SDK2Q58EX2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SDK2Q58EX2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SDK2Q58EX2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SDK2Q58EX2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SDK2Q58EX2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SDK2Q58EX2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SDK2Q58EX2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SDK2Q58EX2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SDK2Q58EX2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SDK2Q58EX2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SDK2Q58EX2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SDK2Q58EX2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SDK2Q58EX2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SDK2Q58EX2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SDK2Q58EX2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SDK2Q58EX2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SDK2Q58EX2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms