Protein–RNA interactions for Protein: Q53HC9

EIPR1, EARP-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIPR1Q53HC9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIPR1Q53HC9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIPR1Q53HC9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIPR1Q53HC9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
EIPR1Q53HC9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIPR1Q53HC9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIPR1Q53HC9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
EIPR1Q53HC9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIPR1Q53HC9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIPR1Q53HC9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIPR1Q53HC9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
EIPR1Q53HC9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
EIPR1Q53HC9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
EIPR1Q53HC9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
EIPR1Q53HC9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
EIPR1Q53HC9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
EIPR1Q53HC9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
EIPR1Q53HC9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
EIPR1Q53HC9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
EIPR1Q53HC9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIPR1Q53HC9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIPR1Q53HC9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
EIPR1Q53HC9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
EIPR1Q53HC9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EIPR1Q53HC9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EIPR1Q53HC9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EIPR1Q53HC9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EIPR1Q53HC9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EIPR1Q53HC9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EIPR1Q53HC9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EIPR1Q53HC9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
EIPR1Q53HC9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EIPR1Q53HC9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EIPR1Q53HC9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EIPR1Q53HC9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EIPR1Q53HC9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EIPR1Q53HC9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EIPR1Q53HC9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EIPR1Q53HC9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EIPR1Q53HC9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EIPR1Q53HC9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EIPR1Q53HC9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EIPR1Q53HC9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EIPR1Q53HC9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EIPR1Q53HC9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EIPR1Q53HC9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EIPR1Q53HC9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EIPR1Q53HC9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
EIPR1Q53HC9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
EIPR1Q53HC9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
EIPR1Q53HC9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
EIPR1Q53HC9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EIPR1Q53HC9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EIPR1Q53HC9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EIPR1Q53HC9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EIPR1Q53HC9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EIPR1Q53HC9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EIPR1Q53HC9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EIPR1Q53HC9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EIPR1Q53HC9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EIPR1Q53HC9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EIPR1Q53HC9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EIPR1Q53HC9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EIPR1Q53HC9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EIPR1Q53HC9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EIPR1Q53HC9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EIPR1Q53HC9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EIPR1Q53HC9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EIPR1Q53HC9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EIPR1Q53HC9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EIPR1Q53HC9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EIPR1Q53HC9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EIPR1Q53HC9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EIPR1Q53HC9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EIPR1Q53HC9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EIPR1Q53HC9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EIPR1Q53HC9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EIPR1Q53HC9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EIPR1Q53HC9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EIPR1Q53HC9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EIPR1Q53HC9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EIPR1Q53HC9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EIPR1Q53HC9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EIPR1Q53HC9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EIPR1Q53HC9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EIPR1Q53HC9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EIPR1Q53HC9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EIPR1Q53HC9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EIPR1Q53HC9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EIPR1Q53HC9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EIPR1Q53HC9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EIPR1Q53HC9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EIPR1Q53HC9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
EIPR1Q53HC9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EIPR1Q53HC9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EIPR1Q53HC9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EIPR1Q53HC9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EIPR1Q53HC9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EIPR1Q53HC9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EIPR1Q53HC9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms