Protein–RNA interactions for Protein: Q16594

TAF9, Transcription initiation factor TFIID subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF9Q16594 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF9Q16594 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF9Q16594 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF9Q16594 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF9Q16594 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF9Q16594 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF9Q16594 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF9Q16594 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF9Q16594 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF9Q16594 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF9Q16594 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF9Q16594 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF9Q16594 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF9Q16594 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF9Q16594 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF9Q16594 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF9Q16594 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF9Q16594 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF9Q16594 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF9Q16594 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF9Q16594 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF9Q16594 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF9Q16594 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF9Q16594 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF9Q16594 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF9Q16594 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF9Q16594 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF9Q16594 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF9Q16594 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF9Q16594 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF9Q16594 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF9Q16594 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF9Q16594 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
TAF9Q16594 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TAF9Q16594 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF9Q16594 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF9Q16594 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF9Q16594 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF9Q16594 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF9Q16594 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF9Q16594 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF9Q16594 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF9Q16594 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF9Q16594 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF9Q16594 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF9Q16594 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF9Q16594 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF9Q16594 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF9Q16594 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF9Q16594 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF9Q16594 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF9Q16594 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF9Q16594 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF9Q16594 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF9Q16594 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF9Q16594 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF9Q16594 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF9Q16594 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF9Q16594 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF9Q16594 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF9Q16594 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF9Q16594 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF9Q16594 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF9Q16594 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF9Q16594 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF9Q16594 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF9Q16594 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF9Q16594 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF9Q16594 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF9Q16594 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF9Q16594 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF9Q16594 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF9Q16594 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF9Q16594 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TAF9Q16594 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TAF9Q16594 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TAF9Q16594 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TAF9Q16594 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TAF9Q16594 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TAF9Q16594 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TAF9Q16594 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TAF9Q16594 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TAF9Q16594 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TAF9Q16594 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TAF9Q16594 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TAF9Q16594 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TAF9Q16594 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TAF9Q16594 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TAF9Q16594 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TAF9Q16594 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TAF9Q16594 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
TAF9Q16594 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TAF9Q16594 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TAF9Q16594 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TAF9Q16594 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TAF9Q16594 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TAF9Q16594 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
TAF9Q16594 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF9Q16594 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF9Q16594 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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