Protein–RNA interactions for Protein: Q15835

GRK1, Rhodopsin kinase, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRK1Q15835 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRK1Q15835 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRK1Q15835 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRK1Q15835 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRK1Q15835 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRK1Q15835 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRK1Q15835 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRK1Q15835 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRK1Q15835 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRK1Q15835 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRK1Q15835 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRK1Q15835 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRK1Q15835 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GRK1Q15835 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRK1Q15835 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRK1Q15835 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRK1Q15835 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRK1Q15835 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRK1Q15835 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRK1Q15835 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRK1Q15835 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRK1Q15835 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GRK1Q15835 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRK1Q15835 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRK1Q15835 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRK1Q15835 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRK1Q15835 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GRK1Q15835 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRK1Q15835 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRK1Q15835 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRK1Q15835 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRK1Q15835 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRK1Q15835 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRK1Q15835 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRK1Q15835 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
GRK1Q15835 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRK1Q15835 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRK1Q15835 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRK1Q15835 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRK1Q15835 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRK1Q15835 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRK1Q15835 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRK1Q15835 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GRK1Q15835 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRK1Q15835 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRK1Q15835 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRK1Q15835 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRK1Q15835 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRK1Q15835 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRK1Q15835 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRK1Q15835 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRK1Q15835 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRK1Q15835 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRK1Q15835 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRK1Q15835 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRK1Q15835 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRK1Q15835 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRK1Q15835 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRK1Q15835 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRK1Q15835 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRK1Q15835 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRK1Q15835 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRK1Q15835 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GRK1Q15835 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRK1Q15835 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRK1Q15835 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRK1Q15835 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRK1Q15835 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GRK1Q15835 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GRK1Q15835 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GRK1Q15835 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GRK1Q15835 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRK1Q15835 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRK1Q15835 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRK1Q15835 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRK1Q15835 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GRK1Q15835 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRK1Q15835 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRK1Q15835 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRK1Q15835 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRK1Q15835 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRK1Q15835 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRK1Q15835 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRK1Q15835 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRK1Q15835 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRK1Q15835 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRK1Q15835 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRK1Q15835 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRK1Q15835 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRK1Q15835 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRK1Q15835 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRK1Q15835 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRK1Q15835 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRK1Q15835 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRK1Q15835 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GRK1Q15835 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRK1Q15835 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRK1Q15835 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRK1Q15835 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRK1Q15835 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.8 ms