Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
COL4A6Q14031 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
COL4A6Q14031 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
COL4A6Q14031 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
COL4A6Q14031 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
COL4A6Q14031 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
COL4A6Q14031 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
COL4A6Q14031 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
COL4A6Q14031 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
COL4A6Q14031 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
COL4A6Q14031 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
COL4A6Q14031 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
COL4A6Q14031 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
COL4A6Q14031 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
COL4A6Q14031 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
COL4A6Q14031 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
COL4A6Q14031 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
COL4A6Q14031 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
COL4A6Q14031 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
COL4A6Q14031 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
COL4A6Q14031 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
COL4A6Q14031 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
COL4A6Q14031 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
COL4A6Q14031 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
COL4A6Q14031 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
COL4A6Q14031 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
COL4A6Q14031 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
COL4A6Q14031 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
COL4A6Q14031 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
COL4A6Q14031 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
COL4A6Q14031 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
COL4A6Q14031 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
COL4A6Q14031 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
COL4A6Q14031 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
COL4A6Q14031 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
COL4A6Q14031 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
COL4A6Q14031 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
COL4A6Q14031 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
COL4A6Q14031 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
COL4A6Q14031 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
COL4A6Q14031 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
COL4A6Q14031 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
COL4A6Q14031 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
COL4A6Q14031 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
COL4A6Q14031 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
COL4A6Q14031 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
COL4A6Q14031 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
COL4A6Q14031 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
COL4A6Q14031 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
COL4A6Q14031 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
COL4A6Q14031 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
COL4A6Q14031 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
COL4A6Q14031 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
COL4A6Q14031 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
COL4A6Q14031 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
COL4A6Q14031 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
COL4A6Q14031 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
COL4A6Q14031 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
COL4A6Q14031 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
COL4A6Q14031 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
COL4A6Q14031 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
COL4A6Q14031 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
COL4A6Q14031 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
COL4A6Q14031 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
COL4A6Q14031 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
COL4A6Q14031 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
COL4A6Q14031 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
COL4A6Q14031 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
COL4A6Q14031 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
COL4A6Q14031 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
COL4A6Q14031 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
COL4A6Q14031 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
COL4A6Q14031 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
COL4A6Q14031 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
COL4A6Q14031 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
COL4A6Q14031 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
COL4A6Q14031 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
COL4A6Q14031 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
COL4A6Q14031 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
COL4A6Q14031 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
COL4A6Q14031 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
COL4A6Q14031 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
COL4A6Q14031 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
COL4A6Q14031 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
COL4A6Q14031 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
COL4A6Q14031 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
COL4A6Q14031 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
COL4A6Q14031 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
COL4A6Q14031 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
COL4A6Q14031 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
COL4A6Q14031 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
COL4A6Q14031 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
COL4A6Q14031 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
COL4A6Q14031 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
COL4A6Q14031 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
COL4A6Q14031 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
COL4A6Q14031 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
COL4A6Q14031 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
COL4A6Q14031 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
COL4A6Q14031 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
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