Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBE2V1Q13404 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBE2V1Q13404 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBE2V1Q13404 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBE2V1Q13404 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBE2V1Q13404 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBE2V1Q13404 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBE2V1Q13404 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBE2V1Q13404 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBE2V1Q13404 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBE2V1Q13404 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBE2V1Q13404 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBE2V1Q13404 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBE2V1Q13404 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBE2V1Q13404 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBE2V1Q13404 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBE2V1Q13404 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBE2V1Q13404 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBE2V1Q13404 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBE2V1Q13404 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBE2V1Q13404 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBE2V1Q13404 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBE2V1Q13404 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBE2V1Q13404 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBE2V1Q13404 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBE2V1Q13404 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBE2V1Q13404 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBE2V1Q13404 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBE2V1Q13404 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBE2V1Q13404 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBE2V1Q13404 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBE2V1Q13404 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBE2V1Q13404 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE2V1Q13404 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE2V1Q13404 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE2V1Q13404 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE2V1Q13404 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE2V1Q13404 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE2V1Q13404 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBE2V1Q13404 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBE2V1Q13404 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBE2V1Q13404 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBE2V1Q13404 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBE2V1Q13404 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBE2V1Q13404 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBE2V1Q13404 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBE2V1Q13404 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
UBE2V1Q13404 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
UBE2V1Q13404 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
UBE2V1Q13404 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
UBE2V1Q13404 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
UBE2V1Q13404 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
UBE2V1Q13404 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
UBE2V1Q13404 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
UBE2V1Q13404 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
UBE2V1Q13404 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
UBE2V1Q13404 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
UBE2V1Q13404 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
UBE2V1Q13404 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
UBE2V1Q13404 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
UBE2V1Q13404 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
UBE2V1Q13404 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
UBE2V1Q13404 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
UBE2V1Q13404 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBE2V1Q13404 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBE2V1Q13404 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBE2V1Q13404 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBE2V1Q13404 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBE2V1Q13404 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBE2V1Q13404 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
UBE2V1Q13404 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBE2V1Q13404 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBE2V1Q13404 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBE2V1Q13404 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBE2V1Q13404 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBE2V1Q13404 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBE2V1Q13404 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
UBE2V1Q13404 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBE2V1Q13404 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBE2V1Q13404 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE2V1Q13404 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE2V1Q13404 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE2V1Q13404 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE2V1Q13404 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE2V1Q13404 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE2V1Q13404 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBE2V1Q13404 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBE2V1Q13404 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBE2V1Q13404 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
UBE2V1Q13404 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
UBE2V1Q13404 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UBE2V1Q13404 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UBE2V1Q13404 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UBE2V1Q13404 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UBE2V1Q13404 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UBE2V1Q13404 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UBE2V1Q13404 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBE2V1Q13404 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBE2V1Q13404 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBE2V1Q13404 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
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