Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Length 168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PMS2P3Q13401 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PMS2P3Q13401 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PMS2P3Q13401 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PMS2P3Q13401 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PMS2P3Q13401 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PMS2P3Q13401 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PMS2P3Q13401 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PMS2P3Q13401 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PMS2P3Q13401 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PMS2P3Q13401 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PMS2P3Q13401 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PMS2P3Q13401 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PMS2P3Q13401 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PMS2P3Q13401 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PMS2P3Q13401 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PMS2P3Q13401 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PMS2P3Q13401 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PMS2P3Q13401 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PMS2P3Q13401 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PMS2P3Q13401 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PMS2P3Q13401 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PMS2P3Q13401 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PMS2P3Q13401 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PMS2P3Q13401 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PMS2P3Q13401 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PMS2P3Q13401 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PMS2P3Q13401 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PMS2P3Q13401 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PMS2P3Q13401 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PMS2P3Q13401 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PMS2P3Q13401 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PMS2P3Q13401 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PMS2P3Q13401 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PMS2P3Q13401 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PMS2P3Q13401 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PMS2P3Q13401 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PMS2P3Q13401 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PMS2P3Q13401 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PMS2P3Q13401 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PMS2P3Q13401 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PMS2P3Q13401 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PMS2P3Q13401 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PMS2P3Q13401 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PMS2P3Q13401 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PMS2P3Q13401 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PMS2P3Q13401 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PMS2P3Q13401 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PMS2P3Q13401 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PMS2P3Q13401 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PMS2P3Q13401 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PMS2P3Q13401 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PMS2P3Q13401 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PMS2P3Q13401 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PMS2P3Q13401 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PMS2P3Q13401 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PMS2P3Q13401 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PMS2P3Q13401 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PMS2P3Q13401 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PMS2P3Q13401 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PMS2P3Q13401 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PMS2P3Q13401 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PMS2P3Q13401 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PMS2P3Q13401 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PMS2P3Q13401 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PMS2P3Q13401 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PMS2P3Q13401 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PMS2P3Q13401 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PMS2P3Q13401 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PMS2P3Q13401 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PMS2P3Q13401 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PMS2P3Q13401 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PMS2P3Q13401 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PMS2P3Q13401 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PMS2P3Q13401 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PMS2P3Q13401 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PMS2P3Q13401 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PMS2P3Q13401 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PMS2P3Q13401 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PMS2P3Q13401 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PMS2P3Q13401 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PMS2P3Q13401 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PMS2P3Q13401 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PMS2P3Q13401 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PMS2P3Q13401 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PMS2P3Q13401 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PMS2P3Q13401 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PMS2P3Q13401 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PMS2P3Q13401 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PMS2P3Q13401 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PMS2P3Q13401 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PMS2P3Q13401 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PMS2P3Q13401 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PMS2P3Q13401 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PMS2P3Q13401 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PMS2P3Q13401 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PMS2P3Q13401 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PMS2P3Q13401 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PMS2P3Q13401 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PMS2P3Q13401 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
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