Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CALCOCO2Q13137 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CALCOCO2Q13137 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CALCOCO2Q13137 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CALCOCO2Q13137 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CALCOCO2Q13137 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CALCOCO2Q13137 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CALCOCO2Q13137 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CALCOCO2Q13137 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CALCOCO2Q13137 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CALCOCO2Q13137 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CALCOCO2Q13137 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CALCOCO2Q13137 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CALCOCO2Q13137 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CALCOCO2Q13137 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CALCOCO2Q13137 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CALCOCO2Q13137 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CALCOCO2Q13137 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CALCOCO2Q13137 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CALCOCO2Q13137 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CALCOCO2Q13137 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CALCOCO2Q13137 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CALCOCO2Q13137 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CALCOCO2Q13137 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CALCOCO2Q13137 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CALCOCO2Q13137 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CALCOCO2Q13137 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CALCOCO2Q13137 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CALCOCO2Q13137 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CALCOCO2Q13137 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CALCOCO2Q13137 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CALCOCO2Q13137 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CALCOCO2Q13137 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CALCOCO2Q13137 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CALCOCO2Q13137 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CALCOCO2Q13137 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CALCOCO2Q13137 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CALCOCO2Q13137 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CALCOCO2Q13137 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CALCOCO2Q13137 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CALCOCO2Q13137 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CALCOCO2Q13137 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CALCOCO2Q13137 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CALCOCO2Q13137 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CALCOCO2Q13137 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CALCOCO2Q13137 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CALCOCO2Q13137 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CALCOCO2Q13137 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CALCOCO2Q13137 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CALCOCO2Q13137 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CALCOCO2Q13137 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CALCOCO2Q13137 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CALCOCO2Q13137 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CALCOCO2Q13137 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CALCOCO2Q13137 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CALCOCO2Q13137 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CALCOCO2Q13137 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CALCOCO2Q13137 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CALCOCO2Q13137 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CALCOCO2Q13137 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CALCOCO2Q13137 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CALCOCO2Q13137 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CALCOCO2Q13137 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CALCOCO2Q13137 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CALCOCO2Q13137 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CALCOCO2Q13137 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CALCOCO2Q13137 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CALCOCO2Q13137 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CALCOCO2Q13137 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CALCOCO2Q13137 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CALCOCO2Q13137 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CALCOCO2Q13137 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CALCOCO2Q13137 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CALCOCO2Q13137 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CALCOCO2Q13137 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CALCOCO2Q13137 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CALCOCO2Q13137 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CALCOCO2Q13137 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CALCOCO2Q13137 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CALCOCO2Q13137 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CALCOCO2Q13137 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CALCOCO2Q13137 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CALCOCO2Q13137 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CALCOCO2Q13137 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CALCOCO2Q13137 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CALCOCO2Q13137 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CALCOCO2Q13137 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CALCOCO2Q13137 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CALCOCO2Q13137 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CALCOCO2Q13137 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CALCOCO2Q13137 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CALCOCO2Q13137 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CALCOCO2Q13137 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CALCOCO2Q13137 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CALCOCO2Q13137 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CALCOCO2Q13137 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CALCOCO2Q13137 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CALCOCO2Q13137 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CALCOCO2Q13137 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CALCOCO2Q13137 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
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