Protein–RNA interactions for Protein: Q12849

GRSF1, G-rich sequence factor 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRSF1Q12849 AHSA1-206ENST00000555457 641 ntTSL 316.22■□□□□ 0.196e-6■■■■□ 20.5
GRSF1Q12849 SCLY-205ENST00000416757 807 ntTSL 216.07■□□□□ 0.166e-6■■■■□ 20.5
GRSF1Q12849 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.126e-6■■■■□ 20.5
GRSF1Q12849 SCLY-206ENST00000423324 628 ntTSL 415.65■□□□□ 0.16e-6■■■■□ 20.5
GRSF1Q12849 CNTROB-212ENST00000576538 784 ntTSL 515.02■□□□□ -06e-6■■■■□ 20.5
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GRSF1Q12849 ARHGEF39-205ENST00000490638 4498 ntTSL 1 (best)14.55□□□□□ -0.086e-6■■■■□ 20.5
GRSF1Q12849 SCLY-215ENST00000480357 5668 ntTSL 1 (best)14.44□□□□□ -0.16e-6■■■■□ 20.5
GRSF1Q12849 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.246e-6■■■■□ 20.5
GRSF1Q12849 ARHGEF39-203ENST00000475323 2862 ntTSL 213.43□□□□□ -0.266e-6■■■■□ 20.5
GRSF1Q12849 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.36e-6■■■■□ 20.5
GRSF1Q12849 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.326e-6■■■■□ 20.5
GRSF1Q12849 NSD2-206ENST00000382895 7827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.326e-6■■■■□ 20.5
GRSF1Q12849 QPRT-204ENST00000564967 2199 nt13□□□□□ -0.336e-6■■■■□ 20.5
GRSF1Q12849 UBE2F-SCLY-202ENST00000449891 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 212.92□□□□□ -0.346e-6■■■■□ 20.5
GRSF1Q12849 CELSR3-201ENST00000164024 11956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.366e-6■■■■□ 20.5
GRSF1Q12849 AHSA1-210ENST00000556369 849 ntTSL 512.44□□□□□ -0.426e-6■■■■□ 20.5
GRSF1Q12849 NSD2-205ENST00000382892 7706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.436e-6■■■■□ 20.5
GRSF1Q12849 CNTROB-202ENST00000563694 3705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.476e-6■■■■□ 20.5
GRSF1Q12849 CNTROB-201ENST00000380262 3769 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.496e-6■■■■□ 20.5
GRSF1Q12849 NSD2-202ENST00000353275 7980 ntTSL 1 (best)11.89□□□□□ -0.516e-6■■■■□ 20.5
GRSF1Q12849 NSD2-210ENST00000482415 3602 ntTSL 1 (best)11.88□□□□□ -0.516e-6■■■■□ 20.5
GRSF1Q12849 NSD2-201ENST00000312087 8050 ntTSL 1 (best)10.83□□□□□ -0.686e-6■■■■□ 20.5
GRSF1Q12849 UBE2F-SCLY-201ENST00000449191 951 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.76e-6■■■■□ 20.5
GRSF1Q12849 ARHGEF39-201ENST00000378387 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.736e-6■■■■□ 20.5
GRSF1Q12849 NSD2-219ENST00000508803 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.086e-6■■■■□ 20.5
GRSF1Q12849 SCLY-218ENST00000487197 770 ntTSL 27.22□□□□□ -1.256e-6■■■■□ 20.5
GRSF1Q12849 ATF6-201ENST00000367942 7496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.192e-14■■■■□ 20.5
GRSF1Q12849 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC2.41□□□□□ -2.021e-323■■■■□ 20.4
GRSF1Q12849 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.221e-13■■■■□ 20.4
GRSF1Q12849 CNP-202ENST00000393892 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.31e-13■■■■□ 20.4
GRSF1Q12849 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.019e-9■■■■□ 20.4
GRSF1Q12849 PLXNB1-201ENST00000296440 7143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.249e-9■■■■□ 20.4
GRSF1Q12849 SEC14L1-204ENST00000436233 5295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.462e-8■■■■□ 20.2
GRSF1Q12849 SEC14L1-202ENST00000430767 5283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.562e-8■■■■□ 20.2
GRSF1Q12849 SEC14L1-205ENST00000443798 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.652e-8■■■■□ 20.2
GRSF1Q12849 SEC14L1-201ENST00000392476 2957 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.772e-8■■■■□ 20.2
GRSF1Q12849 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.751e-6■■■■□ 20.2
GRSF1Q12849 GAA-202ENST00000390015 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.582e-18■■■■□ 20.2
GRSF1Q12849 GAA-201ENST00000302262 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.642e-18■■■■□ 20.2
GRSF1Q12849 PAQR8-201ENST00000360726 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.71e-7■■■■□ 20.2
GRSF1Q12849 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.21e-6■■■■□ 20.2
GRSF1Q12849 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.011e-6■■■■□ 20.2
GRSF1Q12849 DHRS2-209ENST00000557535 927 ntTSL 518.21■□□□□ 0.519e-17■■■■□ 20.1
GRSF1Q12849 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.26e-7■■■■□ 20
GRSF1Q12849 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.166e-7■■■■□ 20
GRSF1Q12849 AP3D1-208ENST00000590683 723 ntTSL 59.63□□□□□ -0.876e-7■■■■□ 20
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GRSF1Q12849 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.215e-8■■■■□ 19.9
GRSF1Q12849 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.965e-8■■■■□ 19.9
GRSF1Q12849 PARP10-202ENST00000313059 1090 ntTSL 1 (best)21.14■□□□□ 0.974e-8■■■■□ 19.9
GRSF1Q12849 PARP10-209ENST00000527262 3027 ntTSL 1 (best)15.06■□□□□ 04e-8■■■■□ 19.9
GRSF1Q12849 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.084e-8■■■■□ 19.9
GRSF1Q12849 PARP10-205ENST00000525773 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.344e-8■■■■□ 19.9
GRSF1Q12849 PARP10-203ENST00000524918 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.364e-8■■■■□ 19.9
GRSF1Q12849 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.573e-7■■■■□ 19.7
GRSF1Q12849 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.914e-16■■■■□ 19.7
GRSF1Q12849 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.444e-16■■■■□ 19.7
GRSF1Q12849 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.314e-16■■■■□ 19.7
GRSF1Q12849 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.044e-16■■■■□ 19.7
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GRSF1Q12849 NEDD4L-204ENST00000382850 8251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.061e-11■■■■□ 19.7
GRSF1Q12849 RAB40C-209ENST00000565511 783 ntTSL 325.29■■□□□ 1.643e-7■■■■□ 19.7
GRSF1Q12849 RAB40C-207ENST00000563109 710 ntTSL 319.37■□□□□ 0.693e-7■■■■□ 19.7
GRSF1Q12849 RAB40C-202ENST00000509637 565 ntTSL 317.09■□□□□ 0.333e-7■■■■□ 19.7
GRSF1Q12849 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.083e-6■■■■□ 19.7
GRSF1Q12849 RPS2-211ENST00000531065 1548 ntTSL 528.53■■■□□ 2.168e-29■■■■□ 19.6
GRSF1Q12849 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.058e-29■■■■□ 19.6
GRSF1Q12849 RPS2-205ENST00000527109 1030 ntTSL 1 (best)27.44■■□□□ 1.988e-29■■■■□ 19.6
GRSF1Q12849 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.988e-29■■■■□ 19.6
GRSF1Q12849 RPS2-207ENST00000527826 837 ntTSL 1 (best)27.44■■□□□ 1.988e-29■■■■□ 19.6
GRSF1Q12849 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.988e-29■■■■□ 19.6
GRSF1Q12849 RPS2-206ENST00000527302 719 ntTSL 327.07■■□□□ 1.928e-29■■■■□ 19.6
GRSF1Q12849 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.778e-29■■■■□ 19.6
GRSF1Q12849 RPS2-208ENST00000527871 1243 ntTSL 1 (best)26.01■■□□□ 1.758e-29■■■■□ 19.6
GRSF1Q12849 RPS2-213ENST00000533161 1186 ntTSL 1 (best)25.7■■□□□ 1.78e-29■■■■□ 19.6
GRSF1Q12849 RPS2-215ENST00000533872 1114 ntTSL 525.39■■□□□ 1.668e-29■■■■□ 19.6
GRSF1Q12849 RPS2-204ENST00000526908 638 ntTSL 221.72■■□□□ 1.078e-29■■■■□ 19.6
GRSF1Q12849 RPS2-217ENST00000563194 170 ntTSL 52.9□□□□□ -1.958e-29■■■■□ 19.6
GRSF1Q12849 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.971e-19■■■■□ 19.5
GRSF1Q12849 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.971e-19■■■■□ 19.5
GRSF1Q12849 REXO2-215ENST00000544010 848 ntTSL 220.84■□□□□ 0.931e-19■■■■□ 19.5
GRSF1Q12849 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.921e-19■■■■□ 19.5
GRSF1Q12849 REXO2-207ENST00000539333 651 ntTSL 220.64■□□□□ 0.891e-19■■■■□ 19.5
GRSF1Q12849 REXO2-214ENST00000543243 552 ntTSL 219.2■□□□□ 0.661e-19■■■■□ 19.5
GRSF1Q12849 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.661e-19■■■■□ 19.5
GRSF1Q12849 REXO2-202ENST00000538198 449 ntTSL 319■□□□□ 0.631e-19■■■■□ 19.5
GRSF1Q12849 REXO2-211ENST00000541703 475 ntTSL 318.82■□□□□ 0.61e-19■■■■□ 19.5
GRSF1Q12849 REXO2-213ENST00000543131 539 ntTSL 318.82■□□□□ 0.61e-19■■■■□ 19.5
GRSF1Q12849 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.571e-19■■■■□ 19.5
GRSF1Q12849 ZGPAT-210ENST00000478385 935 ntTSL 218.24■□□□□ 0.512e-6■■■■□ 19.5
GRSF1Q12849 REXO2-205ENST00000539119 664 ntTSL 316.41■□□□□ 0.221e-19■■■■□ 19.5
GRSF1Q12849 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.741e-19■■■■□ 19.5
GRSF1Q12849 LAMP1-203ENST00000472564 5242 ntTSL 216.52■□□□□ 0.232e-7■■■■□ 19.5
GRSF1Q12849 DHRS2-205ENST00000553896 1352 ntTSL 1 (best)20.89■□□□□ 0.938e-22■■■■□ 19.4
GRSF1Q12849 RABL6-208ENST00000464941 3361 ntTSL 215.9■□□□□ 0.146e-13■■■■□ 19.4
GRSF1Q12849 EFHC1-204ENST00000491749 496 ntTSL 426.03■■□□□ 1.763e-7■■■■□ 19.3
GRSF1Q12849 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.683e-7■■■■□ 19.3
GRSF1Q12849 EFHC1-235ENST00000637849 2746 ntTSL 515.59■□□□□ 0.093e-7■■■■□ 19.3
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