Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
TROQ12816 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC39.42■■■■□ 3.9
TROQ12816 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC39.41■■■■□ 3.9
TROQ12816 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
TROQ12816 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC39.4■■■■□ 3.9
TROQ12816 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC39.4■■■■□ 3.9
TROQ12816 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC39.4■■■■□ 3.9
TROQ12816 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.39■■■■□ 3.9
TROQ12816 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
TROQ12816 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
TROQ12816 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC39.38■■■■□ 3.89
TROQ12816 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.38■■■■□ 3.89
TROQ12816 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
TROQ12816 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC39.37■■■■□ 3.89
TROQ12816 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
TROQ12816 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC39.35■■■■□ 3.89
TROQ12816 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
TROQ12816 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC39.34■■■■□ 3.89
TROQ12816 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
TROQ12816 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC39.34■■■■□ 3.89
TROQ12816 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
TROQ12816 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
TROQ12816 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC39.33■■■■□ 3.89
TROQ12816 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC39.33■■■■□ 3.89
TROQ12816 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
TROQ12816 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
TROQ12816 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
TROQ12816 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
TROQ12816 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC39.31■■■■□ 3.88
TROQ12816 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
TROQ12816 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC39.3■■■■□ 3.88
TROQ12816 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC39.3■■■■□ 3.88
TROQ12816 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.3■■■■□ 3.88
TROQ12816 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
TROQ12816 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC39.29■■■■□ 3.88
TROQ12816 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC39.26■■■■□ 3.88
TROQ12816 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC39.26■■■■□ 3.88
TROQ12816 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
TROQ12816 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC39.26■■■■□ 3.88
TROQ12816 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
TROQ12816 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC39.26■■■■□ 3.88
TROQ12816 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC39.25■■■■□ 3.87
TROQ12816 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
TROQ12816 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
TROQ12816 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
TROQ12816 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
TROQ12816 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC39.24■■■■□ 3.87
TROQ12816 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
TROQ12816 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC39.23■■■■□ 3.87
TROQ12816 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC39.23■■■■□ 3.87
TROQ12816 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC39.23■■■■□ 3.87
TROQ12816 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC39.23■■■■□ 3.87
TROQ12816 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
TROQ12816 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC39.22■■■■□ 3.87
TROQ12816 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC39.22■■■■□ 3.87
TROQ12816 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC39.21■■■■□ 3.87
TROQ12816 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC39.2■■■■□ 3.87
TROQ12816 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
TROQ12816 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
TROQ12816 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC39.18■■■■□ 3.86
TROQ12816 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.18■■■■□ 3.86
TROQ12816 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC39.17■■■■□ 3.86
TROQ12816 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC39.17■■■■□ 3.86
TROQ12816 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
TROQ12816 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC39.17■■■■□ 3.86
TROQ12816 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
TROQ12816 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
TROQ12816 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC39.16■■■■□ 3.86
TROQ12816 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.16■■■■□ 3.86
TROQ12816 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
TROQ12816 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC39.16■■■■□ 3.86
TROQ12816 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
TROQ12816 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
TROQ12816 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
TROQ12816 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
TROQ12816 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
TROQ12816 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
TROQ12816 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC39.12■■■■□ 3.85
TROQ12816 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
TROQ12816 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
TROQ12816 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
TROQ12816 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC39.1■■■■□ 3.85
TROQ12816 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC39.09■■■■□ 3.85
TROQ12816 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
TROQ12816 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC39.08■■■■□ 3.85
TROQ12816 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
TROQ12816 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.08■■■■□ 3.85
TROQ12816 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
TROQ12816 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
TROQ12816 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC39.07■■■■□ 3.85
TROQ12816 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
TROQ12816 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
TROQ12816 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC39.06■■■■□ 3.84
TROQ12816 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC39.06■■■■□ 3.84
TROQ12816 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC39.06■■■■□ 3.84
TROQ12816 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
TROQ12816 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC39.04■■■■□ 3.84
TROQ12816 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC39.04■■■■□ 3.84
TROQ12816 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC39.04■■■■□ 3.84
TROQ12816 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC39.03■■■■□ 3.84
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