Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC15Q0P6D6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC15Q0P6D6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC15Q0P6D6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC15Q0P6D6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC15Q0P6D6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC15Q0P6D6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC15Q0P6D6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC15Q0P6D6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC15Q0P6D6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC15Q0P6D6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC15Q0P6D6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC15Q0P6D6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC15Q0P6D6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC15Q0P6D6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC15Q0P6D6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC15Q0P6D6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC15Q0P6D6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC15Q0P6D6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC15Q0P6D6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC15Q0P6D6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC15Q0P6D6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC15Q0P6D6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC15Q0P6D6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC15Q0P6D6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC15Q0P6D6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC15Q0P6D6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CCDC15Q0P6D6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CCDC15Q0P6D6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC15Q0P6D6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC15Q0P6D6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC15Q0P6D6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC15Q0P6D6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC15Q0P6D6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC15Q0P6D6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC15Q0P6D6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC15Q0P6D6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC15Q0P6D6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC15Q0P6D6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC15Q0P6D6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC15Q0P6D6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC15Q0P6D6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC15Q0P6D6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC15Q0P6D6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC15Q0P6D6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC15Q0P6D6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC15Q0P6D6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC15Q0P6D6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC15Q0P6D6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC15Q0P6D6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC15Q0P6D6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC15Q0P6D6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC15Q0P6D6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC15Q0P6D6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC15Q0P6D6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC15Q0P6D6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC15Q0P6D6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC15Q0P6D6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC15Q0P6D6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC15Q0P6D6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC15Q0P6D6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC15Q0P6D6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC15Q0P6D6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC15Q0P6D6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC15Q0P6D6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC15Q0P6D6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC15Q0P6D6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC15Q0P6D6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC15Q0P6D6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC15Q0P6D6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC15Q0P6D6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC15Q0P6D6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC15Q0P6D6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC15Q0P6D6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC15Q0P6D6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC15Q0P6D6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC15Q0P6D6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC15Q0P6D6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC15Q0P6D6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC15Q0P6D6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC15Q0P6D6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC15Q0P6D6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC15Q0P6D6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC15Q0P6D6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC15Q0P6D6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC15Q0P6D6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC15Q0P6D6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC15Q0P6D6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC15Q0P6D6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC15Q0P6D6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC15Q0P6D6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC15Q0P6D6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC15Q0P6D6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC15Q0P6D6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC15Q0P6D6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC15Q0P6D6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC15Q0P6D6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC15Q0P6D6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC15Q0P6D6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC15Q0P6D6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms