Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIPPLY1Q0D2K3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIPPLY1Q0D2K3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIPPLY1Q0D2K3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIPPLY1Q0D2K3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIPPLY1Q0D2K3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIPPLY1Q0D2K3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RIPPLY1Q0D2K3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIPPLY1Q0D2K3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RIPPLY1Q0D2K3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RIPPLY1Q0D2K3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RIPPLY1Q0D2K3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RIPPLY1Q0D2K3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RIPPLY1Q0D2K3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RIPPLY1Q0D2K3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RIPPLY1Q0D2K3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RIPPLY1Q0D2K3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RIPPLY1Q0D2K3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RIPPLY1Q0D2K3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RIPPLY1Q0D2K3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RIPPLY1Q0D2K3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RIPPLY1Q0D2K3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RIPPLY1Q0D2K3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RIPPLY1Q0D2K3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RIPPLY1Q0D2K3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RIPPLY1Q0D2K3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RIPPLY1Q0D2K3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RIPPLY1Q0D2K3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RIPPLY1Q0D2K3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RIPPLY1Q0D2K3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RIPPLY1Q0D2K3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RIPPLY1Q0D2K3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RIPPLY1Q0D2K3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RIPPLY1Q0D2K3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RIPPLY1Q0D2K3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RIPPLY1Q0D2K3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RIPPLY1Q0D2K3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RIPPLY1Q0D2K3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RIPPLY1Q0D2K3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RIPPLY1Q0D2K3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RIPPLY1Q0D2K3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RIPPLY1Q0D2K3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RIPPLY1Q0D2K3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RIPPLY1Q0D2K3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RIPPLY1Q0D2K3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RIPPLY1Q0D2K3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RIPPLY1Q0D2K3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RIPPLY1Q0D2K3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RIPPLY1Q0D2K3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RIPPLY1Q0D2K3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RIPPLY1Q0D2K3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RIPPLY1Q0D2K3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RIPPLY1Q0D2K3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RIPPLY1Q0D2K3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RIPPLY1Q0D2K3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RIPPLY1Q0D2K3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RIPPLY1Q0D2K3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RIPPLY1Q0D2K3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RIPPLY1Q0D2K3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RIPPLY1Q0D2K3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RIPPLY1Q0D2K3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RIPPLY1Q0D2K3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RIPPLY1Q0D2K3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RIPPLY1Q0D2K3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RIPPLY1Q0D2K3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RIPPLY1Q0D2K3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RIPPLY1Q0D2K3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RIPPLY1Q0D2K3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RIPPLY1Q0D2K3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RIPPLY1Q0D2K3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RIPPLY1Q0D2K3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RIPPLY1Q0D2K3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RIPPLY1Q0D2K3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RIPPLY1Q0D2K3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RIPPLY1Q0D2K3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RIPPLY1Q0D2K3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RIPPLY1Q0D2K3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RIPPLY1Q0D2K3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RIPPLY1Q0D2K3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RIPPLY1Q0D2K3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RIPPLY1Q0D2K3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RIPPLY1Q0D2K3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RIPPLY1Q0D2K3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RIPPLY1Q0D2K3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RIPPLY1Q0D2K3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RIPPLY1Q0D2K3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RIPPLY1Q0D2K3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RIPPLY1Q0D2K3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RIPPLY1Q0D2K3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RIPPLY1Q0D2K3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RIPPLY1Q0D2K3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RIPPLY1Q0D2K3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RIPPLY1Q0D2K3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RIPPLY1Q0D2K3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.9 ms