Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
IFFO1Q0D2I5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFFO1Q0D2I5 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFFO1Q0D2I5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFFO1Q0D2I5 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFFO1Q0D2I5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFFO1Q0D2I5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFFO1Q0D2I5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFFO1Q0D2I5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFFO1Q0D2I5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFFO1Q0D2I5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFFO1Q0D2I5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFFO1Q0D2I5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFFO1Q0D2I5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
IFFO1Q0D2I5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
IFFO1Q0D2I5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
IFFO1Q0D2I5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IFFO1Q0D2I5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IFFO1Q0D2I5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IFFO1Q0D2I5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
IFFO1Q0D2I5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IFFO1Q0D2I5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
IFFO1Q0D2I5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IFFO1Q0D2I5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
IFFO1Q0D2I5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
IFFO1Q0D2I5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IFFO1Q0D2I5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
IFFO1Q0D2I5 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
IFFO1Q0D2I5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IFFO1Q0D2I5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IFFO1Q0D2I5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
IFFO1Q0D2I5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
IFFO1Q0D2I5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
IFFO1Q0D2I5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
IFFO1Q0D2I5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
IFFO1Q0D2I5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
IFFO1Q0D2I5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
IFFO1Q0D2I5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
IFFO1Q0D2I5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
IFFO1Q0D2I5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
IFFO1Q0D2I5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
IFFO1Q0D2I5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
IFFO1Q0D2I5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
IFFO1Q0D2I5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
IFFO1Q0D2I5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
IFFO1Q0D2I5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IFFO1Q0D2I5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
IFFO1Q0D2I5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IFFO1Q0D2I5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IFFO1Q0D2I5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IFFO1Q0D2I5 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
IFFO1Q0D2I5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
IFFO1Q0D2I5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IFFO1Q0D2I5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
IFFO1Q0D2I5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IFFO1Q0D2I5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
IFFO1Q0D2I5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IFFO1Q0D2I5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IFFO1Q0D2I5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
IFFO1Q0D2I5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
IFFO1Q0D2I5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
IFFO1Q0D2I5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IFFO1Q0D2I5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
IFFO1Q0D2I5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
IFFO1Q0D2I5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
IFFO1Q0D2I5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
IFFO1Q0D2I5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
IFFO1Q0D2I5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
IFFO1Q0D2I5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
IFFO1Q0D2I5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
IFFO1Q0D2I5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
IFFO1Q0D2I5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IFFO1Q0D2I5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
IFFO1Q0D2I5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IFFO1Q0D2I5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IFFO1Q0D2I5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
IFFO1Q0D2I5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IFFO1Q0D2I5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
IFFO1Q0D2I5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IFFO1Q0D2I5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IFFO1Q0D2I5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IFFO1Q0D2I5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IFFO1Q0D2I5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
IFFO1Q0D2I5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
IFFO1Q0D2I5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
IFFO1Q0D2I5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFFO1Q0D2I5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFFO1Q0D2I5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFFO1Q0D2I5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFFO1Q0D2I5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFFO1Q0D2I5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFFO1Q0D2I5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFFO1Q0D2I5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFFO1Q0D2I5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFFO1Q0D2I5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFFO1Q0D2I5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFFO1Q0D2I5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFFO1Q0D2I5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFFO1Q0D2I5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFFO1Q0D2I5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms