Protein–RNA interactions for Protein: Q08AE8

SPIRE1, Protein spire homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIRE1Q08AE8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SPIRE1Q08AE8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SPIRE1Q08AE8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SPIRE1Q08AE8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
SPIRE1Q08AE8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SPIRE1Q08AE8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SPIRE1Q08AE8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SPIRE1Q08AE8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SPIRE1Q08AE8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SPIRE1Q08AE8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SPIRE1Q08AE8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
SPIRE1Q08AE8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
SPIRE1Q08AE8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
SPIRE1Q08AE8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
SPIRE1Q08AE8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SPIRE1Q08AE8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SPIRE1Q08AE8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SPIRE1Q08AE8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SPIRE1Q08AE8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SPIRE1Q08AE8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SPIRE1Q08AE8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SPIRE1Q08AE8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SPIRE1Q08AE8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SPIRE1Q08AE8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SPIRE1Q08AE8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SPIRE1Q08AE8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SPIRE1Q08AE8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SPIRE1Q08AE8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SPIRE1Q08AE8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SPIRE1Q08AE8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SPIRE1Q08AE8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SPIRE1Q08AE8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SPIRE1Q08AE8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SPIRE1Q08AE8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SPIRE1Q08AE8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SPIRE1Q08AE8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SPIRE1Q08AE8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SPIRE1Q08AE8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SPIRE1Q08AE8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
SPIRE1Q08AE8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SPIRE1Q08AE8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SPIRE1Q08AE8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SPIRE1Q08AE8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SPIRE1Q08AE8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SPIRE1Q08AE8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SPIRE1Q08AE8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SPIRE1Q08AE8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SPIRE1Q08AE8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SPIRE1Q08AE8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SPIRE1Q08AE8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SPIRE1Q08AE8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SPIRE1Q08AE8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SPIRE1Q08AE8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SPIRE1Q08AE8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SPIRE1Q08AE8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
SPIRE1Q08AE8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SPIRE1Q08AE8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SPIRE1Q08AE8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SPIRE1Q08AE8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SPIRE1Q08AE8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SPIRE1Q08AE8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SPIRE1Q08AE8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SPIRE1Q08AE8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SPIRE1Q08AE8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SPIRE1Q08AE8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SPIRE1Q08AE8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SPIRE1Q08AE8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SPIRE1Q08AE8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SPIRE1Q08AE8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SPIRE1Q08AE8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SPIRE1Q08AE8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SPIRE1Q08AE8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SPIRE1Q08AE8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SPIRE1Q08AE8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SPIRE1Q08AE8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SPIRE1Q08AE8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SPIRE1Q08AE8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SPIRE1Q08AE8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SPIRE1Q08AE8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SPIRE1Q08AE8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SPIRE1Q08AE8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SPIRE1Q08AE8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SPIRE1Q08AE8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SPIRE1Q08AE8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SPIRE1Q08AE8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SPIRE1Q08AE8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SPIRE1Q08AE8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SPIRE1Q08AE8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SPIRE1Q08AE8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SPIRE1Q08AE8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SPIRE1Q08AE8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SPIRE1Q08AE8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SPIRE1Q08AE8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SPIRE1Q08AE8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SPIRE1Q08AE8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SPIRE1Q08AE8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SPIRE1Q08AE8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SPIRE1Q08AE8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SPIRE1Q08AE8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SPIRE1Q08AE8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms