Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LTBQ06643 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LTBQ06643 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LTBQ06643 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LTBQ06643 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LTBQ06643 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LTBQ06643 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LTBQ06643 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LTBQ06643 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LTBQ06643 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LTBQ06643 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LTBQ06643 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LTBQ06643 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LTBQ06643 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LTBQ06643 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LTBQ06643 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LTBQ06643 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LTBQ06643 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LTBQ06643 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LTBQ06643 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LTBQ06643 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LTBQ06643 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LTBQ06643 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LTBQ06643 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LTBQ06643 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LTBQ06643 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LTBQ06643 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LTBQ06643 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LTBQ06643 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LTBQ06643 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LTBQ06643 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LTBQ06643 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LTBQ06643 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LTBQ06643 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LTBQ06643 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LTBQ06643 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LTBQ06643 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LTBQ06643 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LTBQ06643 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LTBQ06643 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LTBQ06643 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LTBQ06643 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LTBQ06643 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LTBQ06643 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LTBQ06643 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LTBQ06643 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LTBQ06643 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LTBQ06643 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LTBQ06643 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LTBQ06643 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LTBQ06643 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LTBQ06643 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LTBQ06643 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LTBQ06643 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LTBQ06643 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LTBQ06643 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LTBQ06643 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LTBQ06643 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LTBQ06643 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LTBQ06643 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LTBQ06643 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
LTBQ06643 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LTBQ06643 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LTBQ06643 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LTBQ06643 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LTBQ06643 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LTBQ06643 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LTBQ06643 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LTBQ06643 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LTBQ06643 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LTBQ06643 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LTBQ06643 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LTBQ06643 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LTBQ06643 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LTBQ06643 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LTBQ06643 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LTBQ06643 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LTBQ06643 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LTBQ06643 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LTBQ06643 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LTBQ06643 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LTBQ06643 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LTBQ06643 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LTBQ06643 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LTBQ06643 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LTBQ06643 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LTBQ06643 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LTBQ06643 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LTBQ06643 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LTBQ06643 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LTBQ06643 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LTBQ06643 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LTBQ06643 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LTBQ06643 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LTBQ06643 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LTBQ06643 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LTBQ06643 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LTBQ06643 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LTBQ06643 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LTBQ06643 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms