Protein–RNA interactions for Protein: Q06418

TYRO3, Tyrosine-protein kinase receptor TYRO3, humanhuman

Predictions only

Length 890 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYRO3Q06418 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TYRO3Q06418 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TYRO3Q06418 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TYRO3Q06418 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TYRO3Q06418 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TYRO3Q06418 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
TYRO3Q06418 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
TYRO3Q06418 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
TYRO3Q06418 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TYRO3Q06418 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TYRO3Q06418 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TYRO3Q06418 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TYRO3Q06418 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TYRO3Q06418 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TYRO3Q06418 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TYRO3Q06418 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TYRO3Q06418 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TYRO3Q06418 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TYRO3Q06418 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TYRO3Q06418 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TYRO3Q06418 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TYRO3Q06418 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
TYRO3Q06418 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TYRO3Q06418 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TYRO3Q06418 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TYRO3Q06418 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TYRO3Q06418 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TYRO3Q06418 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TYRO3Q06418 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TYRO3Q06418 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TYRO3Q06418 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TYRO3Q06418 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TYRO3Q06418 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TYRO3Q06418 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TYRO3Q06418 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TYRO3Q06418 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TYRO3Q06418 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TYRO3Q06418 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
TYRO3Q06418 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TYRO3Q06418 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TYRO3Q06418 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TYRO3Q06418 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TYRO3Q06418 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TYRO3Q06418 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TYRO3Q06418 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TYRO3Q06418 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TYRO3Q06418 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TYRO3Q06418 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TYRO3Q06418 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TYRO3Q06418 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TYRO3Q06418 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TYRO3Q06418 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TYRO3Q06418 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TYRO3Q06418 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TYRO3Q06418 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TYRO3Q06418 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TYRO3Q06418 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TYRO3Q06418 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TYRO3Q06418 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TYRO3Q06418 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
TYRO3Q06418 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TYRO3Q06418 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TYRO3Q06418 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TYRO3Q06418 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TYRO3Q06418 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TYRO3Q06418 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TYRO3Q06418 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TYRO3Q06418 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TYRO3Q06418 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TYRO3Q06418 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TYRO3Q06418 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TYRO3Q06418 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
TYRO3Q06418 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TYRO3Q06418 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TYRO3Q06418 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TYRO3Q06418 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
TYRO3Q06418 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TYRO3Q06418 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TYRO3Q06418 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TYRO3Q06418 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TYRO3Q06418 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TYRO3Q06418 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TYRO3Q06418 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TYRO3Q06418 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
TYRO3Q06418 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TYRO3Q06418 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TYRO3Q06418 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TYRO3Q06418 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TYRO3Q06418 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
TYRO3Q06418 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
TYRO3Q06418 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TYRO3Q06418 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TYRO3Q06418 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TYRO3Q06418 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TYRO3Q06418 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TYRO3Q06418 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TYRO3Q06418 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TYRO3Q06418 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TYRO3Q06418 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TYRO3Q06418 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms