Protein–RNA interactions for Protein: Q02535

ID3, DNA-binding protein inhibitor ID-3, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ID3Q02535 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ID3Q02535 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ID3Q02535 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ID3Q02535 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ID3Q02535 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ID3Q02535 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ID3Q02535 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ID3Q02535 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ID3Q02535 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ID3Q02535 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ID3Q02535 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ID3Q02535 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ID3Q02535 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ID3Q02535 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ID3Q02535 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ID3Q02535 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ID3Q02535 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ID3Q02535 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ID3Q02535 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ID3Q02535 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ID3Q02535 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ID3Q02535 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ID3Q02535 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ID3Q02535 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ID3Q02535 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ID3Q02535 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ID3Q02535 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ID3Q02535 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ID3Q02535 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ID3Q02535 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ID3Q02535 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ID3Q02535 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ID3Q02535 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ID3Q02535 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ID3Q02535 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ID3Q02535 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ID3Q02535 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ID3Q02535 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ID3Q02535 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ID3Q02535 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ID3Q02535 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ID3Q02535 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ID3Q02535 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ID3Q02535 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ID3Q02535 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ID3Q02535 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ID3Q02535 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ID3Q02535 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ID3Q02535 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ID3Q02535 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ID3Q02535 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ID3Q02535 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ID3Q02535 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ID3Q02535 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ID3Q02535 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ID3Q02535 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ID3Q02535 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ID3Q02535 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ID3Q02535 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ID3Q02535 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ID3Q02535 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ID3Q02535 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ID3Q02535 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ID3Q02535 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ID3Q02535 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ID3Q02535 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ID3Q02535 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ID3Q02535 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ID3Q02535 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ID3Q02535 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ID3Q02535 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ID3Q02535 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ID3Q02535 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ID3Q02535 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ID3Q02535 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ID3Q02535 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ID3Q02535 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ID3Q02535 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ID3Q02535 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ID3Q02535 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ID3Q02535 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ID3Q02535 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ID3Q02535 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ID3Q02535 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ID3Q02535 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ID3Q02535 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ID3Q02535 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ID3Q02535 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ID3Q02535 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ID3Q02535 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ID3Q02535 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ID3Q02535 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ID3Q02535 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ID3Q02535 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ID3Q02535 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ID3Q02535 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ID3Q02535 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ID3Q02535 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ID3Q02535 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ID3Q02535 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.1 ms