Protein–RNA interactions for Protein: Q02127

DHODH, Dihydroorotate dehydrogenase (quinone), mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHODHQ02127 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DHODHQ02127 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DHODHQ02127 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DHODHQ02127 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DHODHQ02127 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DHODHQ02127 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DHODHQ02127 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
DHODHQ02127 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DHODHQ02127 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DHODHQ02127 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DHODHQ02127 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DHODHQ02127 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DHODHQ02127 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DHODHQ02127 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DHODHQ02127 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DHODHQ02127 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DHODHQ02127 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DHODHQ02127 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DHODHQ02127 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DHODHQ02127 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DHODHQ02127 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DHODHQ02127 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DHODHQ02127 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DHODHQ02127 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DHODHQ02127 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DHODHQ02127 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DHODHQ02127 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DHODHQ02127 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DHODHQ02127 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DHODHQ02127 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DHODHQ02127 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DHODHQ02127 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DHODHQ02127 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DHODHQ02127 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DHODHQ02127 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DHODHQ02127 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
DHODHQ02127 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DHODHQ02127 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DHODHQ02127 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DHODHQ02127 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DHODHQ02127 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DHODHQ02127 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DHODHQ02127 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DHODHQ02127 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DHODHQ02127 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DHODHQ02127 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DHODHQ02127 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DHODHQ02127 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DHODHQ02127 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DHODHQ02127 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DHODHQ02127 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DHODHQ02127 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
DHODHQ02127 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DHODHQ02127 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DHODHQ02127 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DHODHQ02127 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DHODHQ02127 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DHODHQ02127 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
DHODHQ02127 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DHODHQ02127 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DHODHQ02127 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DHODHQ02127 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DHODHQ02127 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DHODHQ02127 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DHODHQ02127 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DHODHQ02127 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
DHODHQ02127 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DHODHQ02127 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DHODHQ02127 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DHODHQ02127 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DHODHQ02127 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DHODHQ02127 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DHODHQ02127 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21■□□□□ 0.95
DHODHQ02127 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
DHODHQ02127 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DHODHQ02127 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DHODHQ02127 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DHODHQ02127 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DHODHQ02127 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
DHODHQ02127 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DHODHQ02127 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DHODHQ02127 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
DHODHQ02127 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DHODHQ02127 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DHODHQ02127 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DHODHQ02127 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DHODHQ02127 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DHODHQ02127 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DHODHQ02127 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DHODHQ02127 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DHODHQ02127 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DHODHQ02127 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DHODHQ02127 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DHODHQ02127 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DHODHQ02127 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DHODHQ02127 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DHODHQ02127 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DHODHQ02127 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DHODHQ02127 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DHODHQ02127 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms