Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DEFA6Q01524 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DEFA6Q01524 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DEFA6Q01524 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DEFA6Q01524 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DEFA6Q01524 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DEFA6Q01524 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DEFA6Q01524 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DEFA6Q01524 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DEFA6Q01524 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
DEFA6Q01524 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DEFA6Q01524 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
DEFA6Q01524 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
DEFA6Q01524 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
DEFA6Q01524 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DEFA6Q01524 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DEFA6Q01524 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DEFA6Q01524 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DEFA6Q01524 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DEFA6Q01524 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DEFA6Q01524 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DEFA6Q01524 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DEFA6Q01524 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DEFA6Q01524 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
DEFA6Q01524 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DEFA6Q01524 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DEFA6Q01524 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DEFA6Q01524 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DEFA6Q01524 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DEFA6Q01524 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DEFA6Q01524 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DEFA6Q01524 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DEFA6Q01524 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DEFA6Q01524 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DEFA6Q01524 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DEFA6Q01524 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DEFA6Q01524 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DEFA6Q01524 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DEFA6Q01524 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DEFA6Q01524 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DEFA6Q01524 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DEFA6Q01524 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DEFA6Q01524 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DEFA6Q01524 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DEFA6Q01524 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DEFA6Q01524 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
DEFA6Q01524 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DEFA6Q01524 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DEFA6Q01524 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DEFA6Q01524 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DEFA6Q01524 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
DEFA6Q01524 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DEFA6Q01524 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DEFA6Q01524 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DEFA6Q01524 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DEFA6Q01524 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DEFA6Q01524 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DEFA6Q01524 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DEFA6Q01524 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
DEFA6Q01524 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DEFA6Q01524 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DEFA6Q01524 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DEFA6Q01524 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DEFA6Q01524 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DEFA6Q01524 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DEFA6Q01524 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DEFA6Q01524 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DEFA6Q01524 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DEFA6Q01524 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DEFA6Q01524 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DEFA6Q01524 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DEFA6Q01524 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DEFA6Q01524 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DEFA6Q01524 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DEFA6Q01524 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DEFA6Q01524 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DEFA6Q01524 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DEFA6Q01524 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DEFA6Q01524 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DEFA6Q01524 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DEFA6Q01524 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DEFA6Q01524 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DEFA6Q01524 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DEFA6Q01524 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DEFA6Q01524 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DEFA6Q01524 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DEFA6Q01524 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DEFA6Q01524 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DEFA6Q01524 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DEFA6Q01524 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DEFA6Q01524 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DEFA6Q01524 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DEFA6Q01524 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DEFA6Q01524 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
DEFA6Q01524 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DEFA6Q01524 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DEFA6Q01524 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DEFA6Q01524 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DEFA6Q01524 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DEFA6Q01524 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms