Protein–RNA interactions for Protein: P82663

MRPS25, 28S ribosomal protein S25, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS25P82663 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MRPS25P82663 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MRPS25P82663 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MRPS25P82663 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MRPS25P82663 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MRPS25P82663 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MRPS25P82663 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MRPS25P82663 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MRPS25P82663 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MRPS25P82663 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MRPS25P82663 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MRPS25P82663 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MRPS25P82663 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MRPS25P82663 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MRPS25P82663 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
MRPS25P82663 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
MRPS25P82663 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
MRPS25P82663 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MRPS25P82663 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MRPS25P82663 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MRPS25P82663 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MRPS25P82663 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MRPS25P82663 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MRPS25P82663 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MRPS25P82663 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MRPS25P82663 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MRPS25P82663 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MRPS25P82663 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MRPS25P82663 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MRPS25P82663 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MRPS25P82663 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MRPS25P82663 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MRPS25P82663 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MRPS25P82663 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MRPS25P82663 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MRPS25P82663 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MRPS25P82663 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MRPS25P82663 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MRPS25P82663 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MRPS25P82663 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MRPS25P82663 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MRPS25P82663 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MRPS25P82663 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MRPS25P82663 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MRPS25P82663 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MRPS25P82663 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MRPS25P82663 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MRPS25P82663 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MRPS25P82663 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MRPS25P82663 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MRPS25P82663 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MRPS25P82663 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MRPS25P82663 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MRPS25P82663 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
MRPS25P82663 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MRPS25P82663 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MRPS25P82663 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MRPS25P82663 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MRPS25P82663 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MRPS25P82663 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MRPS25P82663 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
MRPS25P82663 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MRPS25P82663 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
MRPS25P82663 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MRPS25P82663 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MRPS25P82663 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MRPS25P82663 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MRPS25P82663 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MRPS25P82663 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MRPS25P82663 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MRPS25P82663 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MRPS25P82663 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
MRPS25P82663 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MRPS25P82663 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
MRPS25P82663 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MRPS25P82663 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MRPS25P82663 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MRPS25P82663 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MRPS25P82663 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MRPS25P82663 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MRPS25P82663 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MRPS25P82663 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MRPS25P82663 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MRPS25P82663 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MRPS25P82663 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MRPS25P82663 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MRPS25P82663 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MRPS25P82663 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MRPS25P82663 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MRPS25P82663 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MRPS25P82663 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MRPS25P82663 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MRPS25P82663 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MRPS25P82663 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MRPS25P82663 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MRPS25P82663 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MRPS25P82663 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MRPS25P82663 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MRPS25P82663 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MRPS25P82663 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms