Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
IRX6P78412 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
IRX6P78412 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
IRX6P78412 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
IRX6P78412 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
IRX6P78412 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC32.69■■■□□ 2.82
IRX6P78412 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
IRX6P78412 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
IRX6P78412 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
IRX6P78412 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
IRX6P78412 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
IRX6P78412 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
IRX6P78412 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
IRX6P78412 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
IRX6P78412 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
IRX6P78412 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
IRX6P78412 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
IRX6P78412 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
IRX6P78412 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
IRX6P78412 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
IRX6P78412 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
IRX6P78412 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
IRX6P78412 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
IRX6P78412 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
IRX6P78412 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
IRX6P78412 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
IRX6P78412 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
IRX6P78412 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
IRX6P78412 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
IRX6P78412 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
IRX6P78412 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
IRX6P78412 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
IRX6P78412 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
IRX6P78412 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
IRX6P78412 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
IRX6P78412 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
IRX6P78412 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
IRX6P78412 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
IRX6P78412 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
IRX6P78412 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
IRX6P78412 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
IRX6P78412 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
IRX6P78412 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
IRX6P78412 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
IRX6P78412 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
IRX6P78412 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
IRX6P78412 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
IRX6P78412 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
IRX6P78412 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
IRX6P78412 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
IRX6P78412 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
IRX6P78412 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
IRX6P78412 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
IRX6P78412 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
IRX6P78412 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
IRX6P78412 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
IRX6P78412 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC32.53■■■□□ 2.8
IRX6P78412 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC32.53■■■□□ 2.8
IRX6P78412 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
IRX6P78412 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
IRX6P78412 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
IRX6P78412 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
IRX6P78412 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
IRX6P78412 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
IRX6P78412 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
IRX6P78412 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
IRX6P78412 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
IRX6P78412 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
IRX6P78412 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
IRX6P78412 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
IRX6P78412 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
IRX6P78412 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
IRX6P78412 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
IRX6P78412 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
IRX6P78412 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
IRX6P78412 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
IRX6P78412 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
IRX6P78412 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
IRX6P78412 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
IRX6P78412 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.79
IRX6P78412 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
IRX6P78412 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
IRX6P78412 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
IRX6P78412 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
IRX6P78412 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
IRX6P78412 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
IRX6P78412 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
IRX6P78412 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
IRX6P78412 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
IRX6P78412 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC32.43■■■□□ 2.78
IRX6P78412 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
IRX6P78412 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
IRX6P78412 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
IRX6P78412 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
IRX6P78412 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
IRX6P78412 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
IRX6P78412 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
IRX6P78412 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC32.43■■■□□ 2.78
IRX6P78412 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
IRX6P78412 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms