Protein–RNA interactions for Protein: P68543

UBXN2A, UBX domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN2AP68543 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
UBXN2AP68543 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
UBXN2AP68543 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
UBXN2AP68543 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
UBXN2AP68543 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
UBXN2AP68543 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
UBXN2AP68543 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
UBXN2AP68543 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
UBXN2AP68543 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
UBXN2AP68543 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
UBXN2AP68543 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
UBXN2AP68543 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
UBXN2AP68543 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
UBXN2AP68543 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
UBXN2AP68543 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
UBXN2AP68543 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
UBXN2AP68543 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
UBXN2AP68543 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
UBXN2AP68543 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
UBXN2AP68543 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
UBXN2AP68543 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
UBXN2AP68543 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
UBXN2AP68543 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
UBXN2AP68543 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
UBXN2AP68543 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
UBXN2AP68543 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
UBXN2AP68543 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
UBXN2AP68543 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
UBXN2AP68543 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
UBXN2AP68543 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
UBXN2AP68543 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
UBXN2AP68543 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
UBXN2AP68543 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
UBXN2AP68543 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
UBXN2AP68543 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
UBXN2AP68543 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
UBXN2AP68543 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
UBXN2AP68543 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
UBXN2AP68543 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
UBXN2AP68543 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
UBXN2AP68543 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
UBXN2AP68543 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
UBXN2AP68543 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
UBXN2AP68543 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
UBXN2AP68543 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
UBXN2AP68543 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
UBXN2AP68543 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
UBXN2AP68543 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
UBXN2AP68543 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
UBXN2AP68543 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
UBXN2AP68543 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
UBXN2AP68543 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
UBXN2AP68543 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
UBXN2AP68543 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
UBXN2AP68543 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
UBXN2AP68543 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
UBXN2AP68543 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
UBXN2AP68543 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
UBXN2AP68543 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
UBXN2AP68543 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
UBXN2AP68543 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
UBXN2AP68543 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
UBXN2AP68543 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
UBXN2AP68543 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
UBXN2AP68543 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
UBXN2AP68543 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
UBXN2AP68543 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
UBXN2AP68543 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
UBXN2AP68543 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
UBXN2AP68543 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
UBXN2AP68543 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
UBXN2AP68543 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
UBXN2AP68543 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
UBXN2AP68543 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
UBXN2AP68543 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
UBXN2AP68543 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
UBXN2AP68543 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
UBXN2AP68543 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
UBXN2AP68543 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
UBXN2AP68543 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
UBXN2AP68543 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
UBXN2AP68543 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
UBXN2AP68543 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
UBXN2AP68543 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
UBXN2AP68543 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
UBXN2AP68543 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
UBXN2AP68543 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
UBXN2AP68543 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
UBXN2AP68543 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
UBXN2AP68543 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
UBXN2AP68543 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
UBXN2AP68543 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
UBXN2AP68543 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
UBXN2AP68543 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
UBXN2AP68543 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
UBXN2AP68543 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
UBXN2AP68543 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
UBXN2AP68543 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
UBXN2AP68543 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
UBXN2AP68543 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.2 ms