Protein–RNA interactions for Protein: P63261

ACTG1, Actin, cytoplasmic 2, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG1P63261 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACTG1P63261 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACTG1P63261 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACTG1P63261 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACTG1P63261 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACTG1P63261 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACTG1P63261 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACTG1P63261 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACTG1P63261 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACTG1P63261 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACTG1P63261 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACTG1P63261 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACTG1P63261 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACTG1P63261 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACTG1P63261 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACTG1P63261 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACTG1P63261 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACTG1P63261 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACTG1P63261 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACTG1P63261 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACTG1P63261 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACTG1P63261 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACTG1P63261 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACTG1P63261 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACTG1P63261 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ACTG1P63261 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACTG1P63261 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACTG1P63261 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACTG1P63261 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACTG1P63261 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACTG1P63261 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACTG1P63261 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACTG1P63261 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACTG1P63261 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACTG1P63261 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACTG1P63261 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACTG1P63261 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACTG1P63261 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACTG1P63261 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACTG1P63261 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACTG1P63261 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACTG1P63261 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACTG1P63261 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACTG1P63261 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACTG1P63261 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACTG1P63261 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ACTG1P63261 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACTG1P63261 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACTG1P63261 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACTG1P63261 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ACTG1P63261 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACTG1P63261 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACTG1P63261 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACTG1P63261 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACTG1P63261 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTG1P63261 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTG1P63261 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTG1P63261 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTG1P63261 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTG1P63261 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTG1P63261 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTG1P63261 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTG1P63261 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTG1P63261 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTG1P63261 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTG1P63261 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTG1P63261 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTG1P63261 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTG1P63261 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTG1P63261 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTG1P63261 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTG1P63261 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTG1P63261 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTG1P63261 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTG1P63261 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTG1P63261 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTG1P63261 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTG1P63261 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTG1P63261 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTG1P63261 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTG1P63261 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACTG1P63261 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACTG1P63261 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACTG1P63261 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACTG1P63261 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACTG1P63261 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACTG1P63261 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACTG1P63261 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACTG1P63261 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ACTG1P63261 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ACTG1P63261 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTG1P63261 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTG1P63261 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTG1P63261 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTG1P63261 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTG1P63261 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTG1P63261 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTG1P63261 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTG1P63261 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTG1P63261 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms