Protein–RNA interactions for Protein: P62873

GNB1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB1P62873 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GNB1P62873 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GNB1P62873 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GNB1P62873 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GNB1P62873 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GNB1P62873 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GNB1P62873 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GNB1P62873 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GNB1P62873 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GNB1P62873 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GNB1P62873 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GNB1P62873 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GNB1P62873 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
GNB1P62873 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GNB1P62873 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GNB1P62873 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GNB1P62873 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GNB1P62873 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GNB1P62873 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GNB1P62873 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GNB1P62873 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GNB1P62873 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GNB1P62873 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
GNB1P62873 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GNB1P62873 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GNB1P62873 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GNB1P62873 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GNB1P62873 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GNB1P62873 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GNB1P62873 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GNB1P62873 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GNB1P62873 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GNB1P62873 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GNB1P62873 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GNB1P62873 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GNB1P62873 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GNB1P62873 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GNB1P62873 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GNB1P62873 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GNB1P62873 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GNB1P62873 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GNB1P62873 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GNB1P62873 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GNB1P62873 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GNB1P62873 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GNB1P62873 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GNB1P62873 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GNB1P62873 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GNB1P62873 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GNB1P62873 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GNB1P62873 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GNB1P62873 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GNB1P62873 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GNB1P62873 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GNB1P62873 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GNB1P62873 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GNB1P62873 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GNB1P62873 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GNB1P62873 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GNB1P62873 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GNB1P62873 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GNB1P62873 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
GNB1P62873 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GNB1P62873 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GNB1P62873 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GNB1P62873 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GNB1P62873 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GNB1P62873 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GNB1P62873 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GNB1P62873 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GNB1P62873 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
GNB1P62873 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GNB1P62873 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GNB1P62873 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GNB1P62873 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GNB1P62873 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GNB1P62873 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GNB1P62873 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GNB1P62873 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GNB1P62873 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
GNB1P62873 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GNB1P62873 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GNB1P62873 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GNB1P62873 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GNB1P62873 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GNB1P62873 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GNB1P62873 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GNB1P62873 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GNB1P62873 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GNB1P62873 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GNB1P62873 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GNB1P62873 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GNB1P62873 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GNB1P62873 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GNB1P62873 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GNB1P62873 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GNB1P62873 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GNB1P62873 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GNB1P62873 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GNB1P62873 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms