Protein–RNA interactions for Protein: P60900

PSMA6, Proteasome subunit alpha type-6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA6P60900 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMA6P60900 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMA6P60900 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMA6P60900 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMA6P60900 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMA6P60900 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMA6P60900 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMA6P60900 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMA6P60900 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMA6P60900 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMA6P60900 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMA6P60900 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMA6P60900 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMA6P60900 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMA6P60900 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMA6P60900 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMA6P60900 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMA6P60900 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMA6P60900 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMA6P60900 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMA6P60900 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMA6P60900 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMA6P60900 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PSMA6P60900 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PSMA6P60900 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMA6P60900 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMA6P60900 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMA6P60900 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMA6P60900 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMA6P60900 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMA6P60900 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMA6P60900 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMA6P60900 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMA6P60900 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMA6P60900 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMA6P60900 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMA6P60900 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMA6P60900 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMA6P60900 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMA6P60900 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMA6P60900 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMA6P60900 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMA6P60900 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMA6P60900 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMA6P60900 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMA6P60900 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMA6P60900 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMA6P60900 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMA6P60900 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMA6P60900 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMA6P60900 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMA6P60900 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMA6P60900 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMA6P60900 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMA6P60900 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMA6P60900 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PSMA6P60900 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMA6P60900 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMA6P60900 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMA6P60900 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSMA6P60900 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PSMA6P60900 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PSMA6P60900 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSMA6P60900 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMA6P60900 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMA6P60900 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMA6P60900 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMA6P60900 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMA6P60900 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMA6P60900 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMA6P60900 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMA6P60900 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMA6P60900 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMA6P60900 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMA6P60900 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMA6P60900 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMA6P60900 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMA6P60900 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMA6P60900 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMA6P60900 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMA6P60900 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMA6P60900 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMA6P60900 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMA6P60900 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMA6P60900 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMA6P60900 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMA6P60900 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMA6P60900 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMA6P60900 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMA6P60900 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMA6P60900 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMA6P60900 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMA6P60900 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSMA6P60900 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSMA6P60900 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSMA6P60900 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSMA6P60900 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSMA6P60900 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMA6P60900 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMA6P60900 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms