Protein–RNA interactions for Protein: P59780

AP3S2, AP-3 complex subunit sigma-2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3S2P59780 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
AP3S2P59780 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
AP3S2P59780 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
AP3S2P59780 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AP3S2P59780 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
AP3S2P59780 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AP3S2P59780 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
AP3S2P59780 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
AP3S2P59780 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AP3S2P59780 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AP3S2P59780 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AP3S2P59780 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AP3S2P59780 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AP3S2P59780 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AP3S2P59780 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AP3S2P59780 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AP3S2P59780 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
AP3S2P59780 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AP3S2P59780 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AP3S2P59780 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AP3S2P59780 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
AP3S2P59780 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AP3S2P59780 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AP3S2P59780 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AP3S2P59780 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AP3S2P59780 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AP3S2P59780 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AP3S2P59780 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AP3S2P59780 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AP3S2P59780 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AP3S2P59780 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AP3S2P59780 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AP3S2P59780 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
AP3S2P59780 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP3S2P59780 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP3S2P59780 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP3S2P59780 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
AP3S2P59780 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AP3S2P59780 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AP3S2P59780 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AP3S2P59780 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AP3S2P59780 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
AP3S2P59780 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AP3S2P59780 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
AP3S2P59780 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AP3S2P59780 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AP3S2P59780 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AP3S2P59780 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP3S2P59780 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP3S2P59780 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP3S2P59780 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP3S2P59780 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP3S2P59780 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP3S2P59780 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP3S2P59780 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP3S2P59780 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP3S2P59780 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP3S2P59780 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP3S2P59780 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP3S2P59780 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP3S2P59780 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP3S2P59780 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
AP3S2P59780 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
AP3S2P59780 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP3S2P59780 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP3S2P59780 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP3S2P59780 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP3S2P59780 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP3S2P59780 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP3S2P59780 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP3S2P59780 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP3S2P59780 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP3S2P59780 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP3S2P59780 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP3S2P59780 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP3S2P59780 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP3S2P59780 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP3S2P59780 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP3S2P59780 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AP3S2P59780 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AP3S2P59780 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AP3S2P59780 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AP3S2P59780 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
AP3S2P59780 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AP3S2P59780 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AP3S2P59780 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AP3S2P59780 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AP3S2P59780 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AP3S2P59780 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AP3S2P59780 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AP3S2P59780 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AP3S2P59780 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AP3S2P59780 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AP3S2P59780 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AP3S2P59780 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
AP3S2P59780 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AP3S2P59780 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AP3S2P59780 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
AP3S2P59780 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
AP3S2P59780 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms