Protein–RNA interactions for Protein: P57730

CARD18, Caspase recruitment domain-containing protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 90 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD18P57730 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CARD18P57730 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CARD18P57730 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CARD18P57730 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CARD18P57730 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CARD18P57730 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CARD18P57730 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CARD18P57730 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CARD18P57730 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CARD18P57730 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CARD18P57730 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CARD18P57730 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CARD18P57730 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CARD18P57730 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CARD18P57730 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CARD18P57730 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CARD18P57730 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CARD18P57730 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CARD18P57730 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CARD18P57730 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CARD18P57730 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CARD18P57730 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CARD18P57730 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CARD18P57730 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CARD18P57730 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CARD18P57730 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CARD18P57730 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CARD18P57730 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CARD18P57730 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CARD18P57730 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CARD18P57730 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CARD18P57730 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CARD18P57730 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CARD18P57730 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CARD18P57730 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CARD18P57730 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CARD18P57730 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CARD18P57730 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CARD18P57730 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CARD18P57730 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CARD18P57730 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CARD18P57730 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CARD18P57730 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CARD18P57730 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CARD18P57730 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CARD18P57730 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CARD18P57730 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CARD18P57730 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CARD18P57730 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CARD18P57730 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CARD18P57730 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CARD18P57730 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CARD18P57730 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CARD18P57730 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CARD18P57730 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CARD18P57730 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CARD18P57730 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CARD18P57730 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CARD18P57730 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CARD18P57730 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CARD18P57730 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CARD18P57730 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CARD18P57730 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CARD18P57730 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CARD18P57730 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CARD18P57730 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CARD18P57730 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CARD18P57730 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CARD18P57730 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CARD18P57730 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CARD18P57730 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CARD18P57730 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CARD18P57730 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CARD18P57730 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CARD18P57730 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CARD18P57730 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CARD18P57730 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CARD18P57730 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CARD18P57730 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CARD18P57730 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CARD18P57730 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CARD18P57730 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CARD18P57730 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CARD18P57730 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CARD18P57730 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CARD18P57730 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CARD18P57730 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CARD18P57730 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CARD18P57730 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CARD18P57730 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CARD18P57730 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CARD18P57730 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CARD18P57730 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CARD18P57730 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CARD18P57730 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CARD18P57730 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CARD18P57730 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CARD18P57730 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CARD18P57730 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CARD18P57730 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms