Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTBP2P56545 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTBP2P56545 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTBP2P56545 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CTBP2P56545 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTBP2P56545 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTBP2P56545 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTBP2P56545 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTBP2P56545 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTBP2P56545 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTBP2P56545 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTBP2P56545 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CTBP2P56545 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CTBP2P56545 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CTBP2P56545 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CTBP2P56545 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTBP2P56545 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTBP2P56545 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTBP2P56545 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTBP2P56545 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTBP2P56545 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTBP2P56545 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTBP2P56545 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTBP2P56545 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTBP2P56545 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTBP2P56545 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTBP2P56545 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTBP2P56545 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTBP2P56545 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTBP2P56545 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTBP2P56545 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTBP2P56545 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTBP2P56545 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTBP2P56545 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTBP2P56545 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTBP2P56545 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CTBP2P56545 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTBP2P56545 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CTBP2P56545 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTBP2P56545 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTBP2P56545 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTBP2P56545 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTBP2P56545 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTBP2P56545 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTBP2P56545 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTBP2P56545 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTBP2P56545 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTBP2P56545 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTBP2P56545 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTBP2P56545 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTBP2P56545 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTBP2P56545 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTBP2P56545 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTBP2P56545 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTBP2P56545 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CTBP2P56545 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTBP2P56545 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CTBP2P56545 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTBP2P56545 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTBP2P56545 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTBP2P56545 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTBP2P56545 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTBP2P56545 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTBP2P56545 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CTBP2P56545 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CTBP2P56545 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTBP2P56545 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTBP2P56545 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTBP2P56545 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTBP2P56545 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTBP2P56545 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTBP2P56545 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTBP2P56545 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTBP2P56545 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTBP2P56545 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTBP2P56545 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTBP2P56545 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CTBP2P56545 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CTBP2P56545 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTBP2P56545 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTBP2P56545 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTBP2P56545 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CTBP2P56545 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CTBP2P56545 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CTBP2P56545 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CTBP2P56545 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CTBP2P56545 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CTBP2P56545 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CTBP2P56545 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CTBP2P56545 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CTBP2P56545 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTBP2P56545 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTBP2P56545 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CTBP2P56545 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTBP2P56545 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTBP2P56545 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTBP2P56545 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTBP2P56545 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTBP2P56545 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTBP2P56545 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms