Protein–RNA interactions for Protein: P53365

ARFIP2, Arfaptin-2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP2P53365 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARFIP2P53365 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARFIP2P53365 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARFIP2P53365 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARFIP2P53365 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARFIP2P53365 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARFIP2P53365 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARFIP2P53365 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARFIP2P53365 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARFIP2P53365 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARFIP2P53365 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARFIP2P53365 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARFIP2P53365 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARFIP2P53365 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARFIP2P53365 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ARFIP2P53365 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARFIP2P53365 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARFIP2P53365 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARFIP2P53365 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARFIP2P53365 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARFIP2P53365 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARFIP2P53365 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARFIP2P53365 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARFIP2P53365 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARFIP2P53365 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARFIP2P53365 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARFIP2P53365 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARFIP2P53365 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARFIP2P53365 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARFIP2P53365 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARFIP2P53365 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARFIP2P53365 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ARFIP2P53365 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARFIP2P53365 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARFIP2P53365 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARFIP2P53365 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARFIP2P53365 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARFIP2P53365 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARFIP2P53365 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARFIP2P53365 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARFIP2P53365 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARFIP2P53365 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARFIP2P53365 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARFIP2P53365 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARFIP2P53365 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ARFIP2P53365 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARFIP2P53365 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARFIP2P53365 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARFIP2P53365 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARFIP2P53365 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARFIP2P53365 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARFIP2P53365 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARFIP2P53365 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARFIP2P53365 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ARFIP2P53365 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARFIP2P53365 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ARFIP2P53365 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARFIP2P53365 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARFIP2P53365 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARFIP2P53365 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARFIP2P53365 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARFIP2P53365 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARFIP2P53365 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARFIP2P53365 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARFIP2P53365 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARFIP2P53365 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARFIP2P53365 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARFIP2P53365 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARFIP2P53365 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARFIP2P53365 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARFIP2P53365 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARFIP2P53365 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARFIP2P53365 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ARFIP2P53365 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARFIP2P53365 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARFIP2P53365 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARFIP2P53365 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARFIP2P53365 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARFIP2P53365 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARFIP2P53365 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARFIP2P53365 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARFIP2P53365 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARFIP2P53365 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARFIP2P53365 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARFIP2P53365 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARFIP2P53365 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARFIP2P53365 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARFIP2P53365 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARFIP2P53365 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARFIP2P53365 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARFIP2P53365 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARFIP2P53365 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARFIP2P53365 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARFIP2P53365 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARFIP2P53365 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARFIP2P53365 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARFIP2P53365 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ARFIP2P53365 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARFIP2P53365 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARFIP2P53365 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.7 ms