Protein–RNA interactions for Protein: P52788

SMS, Spermine synthase, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMSP52788 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMSP52788 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMSP52788 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMSP52788 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMSP52788 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMSP52788 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMSP52788 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMSP52788 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMSP52788 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMSP52788 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMSP52788 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMSP52788 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMSP52788 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMSP52788 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMSP52788 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMSP52788 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMSP52788 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMSP52788 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMSP52788 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMSP52788 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMSP52788 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMSP52788 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMSP52788 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMSP52788 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMSP52788 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMSP52788 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMSP52788 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMSP52788 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMSP52788 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMSP52788 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMSP52788 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMSP52788 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMSP52788 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMSP52788 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMSP52788 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMSP52788 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMSP52788 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMSP52788 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMSP52788 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMSP52788 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SMSP52788 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SMSP52788 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SMSP52788 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMSP52788 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMSP52788 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMSP52788 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMSP52788 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMSP52788 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMSP52788 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMSP52788 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMSP52788 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMSP52788 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMSP52788 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMSP52788 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMSP52788 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMSP52788 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMSP52788 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMSP52788 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMSP52788 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMSP52788 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMSP52788 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMSP52788 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMSP52788 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMSP52788 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMSP52788 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMSP52788 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMSP52788 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMSP52788 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SMSP52788 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMSP52788 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMSP52788 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMSP52788 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMSP52788 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMSP52788 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMSP52788 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMSP52788 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMSP52788 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMSP52788 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMSP52788 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SMSP52788 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMSP52788 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMSP52788 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMSP52788 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMSP52788 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SMSP52788 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMSP52788 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SMSP52788 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMSP52788 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMSP52788 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMSP52788 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMSP52788 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMSP52788 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SMSP52788 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMSP52788 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMSP52788 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMSP52788 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMSP52788 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMSP52788 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMSP52788 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMSP52788 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms