Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ETV1P50549 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ETV1P50549 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ETV1P50549 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ETV1P50549 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ETV1P50549 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ETV1P50549 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ETV1P50549 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ETV1P50549 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ETV1P50549 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ETV1P50549 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ETV1P50549 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ETV1P50549 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ETV1P50549 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ETV1P50549 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ETV1P50549 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ETV1P50549 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ETV1P50549 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ETV1P50549 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ETV1P50549 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ETV1P50549 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ETV1P50549 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ETV1P50549 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ETV1P50549 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ETV1P50549 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ETV1P50549 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ETV1P50549 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ETV1P50549 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ETV1P50549 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ETV1P50549 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
ETV1P50549 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ETV1P50549 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ETV1P50549 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ETV1P50549 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ETV1P50549 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ETV1P50549 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ETV1P50549 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ETV1P50549 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ETV1P50549 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ETV1P50549 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ETV1P50549 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ETV1P50549 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ETV1P50549 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ETV1P50549 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ETV1P50549 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ETV1P50549 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ETV1P50549 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ETV1P50549 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ETV1P50549 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ETV1P50549 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ETV1P50549 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ETV1P50549 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ETV1P50549 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ETV1P50549 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ETV1P50549 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ETV1P50549 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ETV1P50549 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ETV1P50549 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ETV1P50549 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ETV1P50549 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ETV1P50549 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ETV1P50549 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ETV1P50549 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ETV1P50549 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ETV1P50549 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ETV1P50549 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ETV1P50549 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ETV1P50549 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ETV1P50549 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ETV1P50549 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ETV1P50549 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ETV1P50549 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ETV1P50549 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ETV1P50549 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ETV1P50549 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ETV1P50549 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ETV1P50549 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ETV1P50549 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ETV1P50549 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ETV1P50549 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ETV1P50549 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ETV1P50549 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ETV1P50549 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ETV1P50549 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ETV1P50549 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ETV1P50549 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ETV1P50549 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ETV1P50549 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ETV1P50549 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ETV1P50549 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ETV1P50549 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ETV1P50549 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ETV1P50549 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ETV1P50549 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ETV1P50549 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ETV1P50549 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ETV1P50549 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ETV1P50549 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ETV1P50549 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ETV1P50549 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms