Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GSK3BP49841 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GSK3BP49841 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GSK3BP49841 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GSK3BP49841 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GSK3BP49841 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GSK3BP49841 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GSK3BP49841 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GSK3BP49841 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GSK3BP49841 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GSK3BP49841 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GSK3BP49841 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GSK3BP49841 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GSK3BP49841 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
GSK3BP49841 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GSK3BP49841 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GSK3BP49841 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GSK3BP49841 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
GSK3BP49841 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GSK3BP49841 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GSK3BP49841 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GSK3BP49841 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GSK3BP49841 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GSK3BP49841 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GSK3BP49841 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GSK3BP49841 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GSK3BP49841 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GSK3BP49841 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GSK3BP49841 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GSK3BP49841 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GSK3BP49841 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GSK3BP49841 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GSK3BP49841 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GSK3BP49841 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GSK3BP49841 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GSK3BP49841 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GSK3BP49841 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GSK3BP49841 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GSK3BP49841 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GSK3BP49841 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GSK3BP49841 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GSK3BP49841 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GSK3BP49841 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GSK3BP49841 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GSK3BP49841 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GSK3BP49841 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GSK3BP49841 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GSK3BP49841 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GSK3BP49841 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GSK3BP49841 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GSK3BP49841 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GSK3BP49841 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GSK3BP49841 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
GSK3BP49841 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GSK3BP49841 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GSK3BP49841 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GSK3BP49841 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GSK3BP49841 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GSK3BP49841 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GSK3BP49841 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GSK3BP49841 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GSK3BP49841 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GSK3BP49841 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GSK3BP49841 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GSK3BP49841 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GSK3BP49841 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GSK3BP49841 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GSK3BP49841 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GSK3BP49841 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GSK3BP49841 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GSK3BP49841 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GSK3BP49841 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GSK3BP49841 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GSK3BP49841 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GSK3BP49841 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GSK3BP49841 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GSK3BP49841 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GSK3BP49841 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GSK3BP49841 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GSK3BP49841 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GSK3BP49841 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GSK3BP49841 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GSK3BP49841 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GSK3BP49841 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GSK3BP49841 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GSK3BP49841 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
GSK3BP49841 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GSK3BP49841 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GSK3BP49841 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GSK3BP49841 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GSK3BP49841 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GSK3BP49841 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GSK3BP49841 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GSK3BP49841 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GSK3BP49841 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GSK3BP49841 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GSK3BP49841 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GSK3BP49841 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GSK3BP49841 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GSK3BP49841 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms