Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLK1P49759 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLK1P49759 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLK1P49759 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLK1P49759 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLK1P49759 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLK1P49759 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CLK1P49759 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLK1P49759 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CLK1P49759 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLK1P49759 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CLK1P49759 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLK1P49759 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLK1P49759 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLK1P49759 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLK1P49759 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLK1P49759 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLK1P49759 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLK1P49759 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLK1P49759 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLK1P49759 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLK1P49759 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLK1P49759 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLK1P49759 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLK1P49759 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLK1P49759 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLK1P49759 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLK1P49759 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLK1P49759 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLK1P49759 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLK1P49759 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLK1P49759 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLK1P49759 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLK1P49759 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLK1P49759 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLK1P49759 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLK1P49759 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLK1P49759 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLK1P49759 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLK1P49759 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLK1P49759 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLK1P49759 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CLK1P49759 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLK1P49759 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLK1P49759 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLK1P49759 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLK1P49759 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLK1P49759 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLK1P49759 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLK1P49759 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLK1P49759 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLK1P49759 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLK1P49759 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLK1P49759 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLK1P49759 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLK1P49759 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLK1P49759 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLK1P49759 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLK1P49759 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLK1P49759 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLK1P49759 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CLK1P49759 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLK1P49759 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLK1P49759 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLK1P49759 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLK1P49759 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLK1P49759 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLK1P49759 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLK1P49759 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLK1P49759 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLK1P49759 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLK1P49759 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLK1P49759 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLK1P49759 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLK1P49759 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLK1P49759 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLK1P49759 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLK1P49759 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLK1P49759 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLK1P49759 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLK1P49759 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLK1P49759 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLK1P49759 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLK1P49759 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLK1P49759 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLK1P49759 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLK1P49759 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLK1P49759 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLK1P49759 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLK1P49759 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLK1P49759 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLK1P49759 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLK1P49759 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLK1P49759 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLK1P49759 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLK1P49759 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLK1P49759 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLK1P49759 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLK1P49759 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLK1P49759 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 214 ms