Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATRXP46100 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ATRXP46100 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATRXP46100 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ATRXP46100 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ATRXP46100 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ATRXP46100 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATRXP46100 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATRXP46100 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ATRXP46100 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATRXP46100 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATRXP46100 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATRXP46100 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ATRXP46100 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ATRXP46100 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATRXP46100 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATRXP46100 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATRXP46100 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATRXP46100 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATRXP46100 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATRXP46100 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATRXP46100 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATRXP46100 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ATRXP46100 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ATRXP46100 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATRXP46100 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATRXP46100 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATRXP46100 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATRXP46100 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATRXP46100 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATRXP46100 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATRXP46100 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ATRXP46100 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATRXP46100 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATRXP46100 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATRXP46100 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATRXP46100 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATRXP46100 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATRXP46100 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ATRXP46100 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATRXP46100 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATRXP46100 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ATRXP46100 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ATRXP46100 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ATRXP46100 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATRXP46100 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATRXP46100 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATRXP46100 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATRXP46100 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ATRXP46100 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATRXP46100 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ATRXP46100 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATRXP46100 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATRXP46100 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATRXP46100 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATRXP46100 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATRXP46100 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATRXP46100 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATRXP46100 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATRXP46100 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATRXP46100 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATRXP46100 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATRXP46100 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATRXP46100 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATRXP46100 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
ATRXP46100 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
ATRXP46100 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATRXP46100 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATRXP46100 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ATRXP46100 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATRXP46100 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATRXP46100 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATRXP46100 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATRXP46100 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATRXP46100 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATRXP46100 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATRXP46100 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATRXP46100 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATRXP46100 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ATRXP46100 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATRXP46100 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATRXP46100 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATRXP46100 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATRXP46100 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ATRXP46100 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATRXP46100 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATRXP46100 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATRXP46100 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATRXP46100 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ATRXP46100 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATRXP46100 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATRXP46100 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATRXP46100 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATRXP46100 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ATRXP46100 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ATRXP46100 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATRXP46100 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATRXP46100 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATRXP46100 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATRXP46100 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms