Protein–RNA interactions for Protein: P43115

PTGER3, Prostaglandin E2 receptor EP3 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3P43115 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTGER3P43115 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTGER3P43115 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTGER3P43115 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTGER3P43115 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTGER3P43115 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTGER3P43115 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTGER3P43115 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTGER3P43115 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTGER3P43115 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTGER3P43115 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTGER3P43115 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTGER3P43115 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTGER3P43115 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTGER3P43115 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTGER3P43115 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTGER3P43115 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTGER3P43115 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTGER3P43115 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PTGER3P43115 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTGER3P43115 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTGER3P43115 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PTGER3P43115 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTGER3P43115 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTGER3P43115 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTGER3P43115 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTGER3P43115 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PTGER3P43115 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTGER3P43115 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTGER3P43115 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PTGER3P43115 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTGER3P43115 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTGER3P43115 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTGER3P43115 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTGER3P43115 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PTGER3P43115 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTGER3P43115 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTGER3P43115 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTGER3P43115 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTGER3P43115 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTGER3P43115 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTGER3P43115 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTGER3P43115 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTGER3P43115 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTGER3P43115 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTGER3P43115 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PTGER3P43115 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTGER3P43115 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTGER3P43115 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PTGER3P43115 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTGER3P43115 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTGER3P43115 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTGER3P43115 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTGER3P43115 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTGER3P43115 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTGER3P43115 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTGER3P43115 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTGER3P43115 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTGER3P43115 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTGER3P43115 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTGER3P43115 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTGER3P43115 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PTGER3P43115 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTGER3P43115 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTGER3P43115 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTGER3P43115 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PTGER3P43115 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTGER3P43115 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTGER3P43115 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTGER3P43115 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTGER3P43115 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PTGER3P43115 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTGER3P43115 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTGER3P43115 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTGER3P43115 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTGER3P43115 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTGER3P43115 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTGER3P43115 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTGER3P43115 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTGER3P43115 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PTGER3P43115 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTGER3P43115 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PTGER3P43115 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PTGER3P43115 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTGER3P43115 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTGER3P43115 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTGER3P43115 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTGER3P43115 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTGER3P43115 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTGER3P43115 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PTGER3P43115 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTGER3P43115 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTGER3P43115 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTGER3P43115 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTGER3P43115 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTGER3P43115 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTGER3P43115 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTGER3P43115 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTGER3P43115 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTGER3P43115 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms