Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARL1P40616 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARL1P40616 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARL1P40616 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARL1P40616 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARL1P40616 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARL1P40616 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARL1P40616 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARL1P40616 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARL1P40616 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARL1P40616 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARL1P40616 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ARL1P40616 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARL1P40616 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARL1P40616 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARL1P40616 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARL1P40616 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARL1P40616 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARL1P40616 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARL1P40616 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARL1P40616 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARL1P40616 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARL1P40616 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARL1P40616 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARL1P40616 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARL1P40616 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARL1P40616 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARL1P40616 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARL1P40616 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARL1P40616 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARL1P40616 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARL1P40616 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARL1P40616 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARL1P40616 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARL1P40616 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARL1P40616 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARL1P40616 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARL1P40616 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARL1P40616 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARL1P40616 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARL1P40616 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARL1P40616 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARL1P40616 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARL1P40616 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARL1P40616 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARL1P40616 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARL1P40616 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARL1P40616 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARL1P40616 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARL1P40616 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARL1P40616 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARL1P40616 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARL1P40616 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARL1P40616 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARL1P40616 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARL1P40616 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARL1P40616 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARL1P40616 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARL1P40616 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARL1P40616 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARL1P40616 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARL1P40616 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARL1P40616 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARL1P40616 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARL1P40616 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARL1P40616 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARL1P40616 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARL1P40616 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARL1P40616 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARL1P40616 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARL1P40616 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARL1P40616 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARL1P40616 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARL1P40616 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARL1P40616 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARL1P40616 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
ARL1P40616 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARL1P40616 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ARL1P40616 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARL1P40616 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARL1P40616 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARL1P40616 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARL1P40616 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARL1P40616 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARL1P40616 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARL1P40616 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARL1P40616 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARL1P40616 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARL1P40616 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ARL1P40616 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARL1P40616 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARL1P40616 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARL1P40616 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARL1P40616 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARL1P40616 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARL1P40616 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARL1P40616 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARL1P40616 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARL1P40616 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARL1P40616 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms