Protein–RNA interactions for Protein: P38117

ETFB, Electron transfer flavoprotein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFBP38117 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ETFBP38117 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ETFBP38117 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ETFBP38117 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ETFBP38117 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ETFBP38117 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ETFBP38117 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ETFBP38117 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ETFBP38117 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ETFBP38117 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ETFBP38117 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ETFBP38117 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ETFBP38117 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ETFBP38117 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ETFBP38117 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ETFBP38117 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ETFBP38117 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ETFBP38117 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ETFBP38117 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ETFBP38117 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ETFBP38117 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ETFBP38117 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ETFBP38117 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ETFBP38117 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ETFBP38117 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ETFBP38117 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ETFBP38117 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ETFBP38117 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ETFBP38117 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ETFBP38117 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ETFBP38117 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ETFBP38117 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ETFBP38117 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ETFBP38117 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ETFBP38117 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ETFBP38117 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ETFBP38117 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ETFBP38117 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ETFBP38117 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ETFBP38117 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ETFBP38117 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ETFBP38117 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ETFBP38117 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ETFBP38117 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ETFBP38117 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ETFBP38117 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ETFBP38117 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ETFBP38117 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ETFBP38117 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ETFBP38117 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ETFBP38117 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ETFBP38117 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ETFBP38117 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ETFBP38117 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ETFBP38117 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ETFBP38117 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ETFBP38117 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ETFBP38117 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ETFBP38117 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ETFBP38117 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ETFBP38117 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ETFBP38117 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ETFBP38117 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ETFBP38117 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ETFBP38117 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ETFBP38117 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ETFBP38117 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ETFBP38117 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ETFBP38117 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ETFBP38117 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ETFBP38117 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ETFBP38117 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ETFBP38117 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ETFBP38117 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ETFBP38117 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ETFBP38117 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ETFBP38117 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ETFBP38117 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ETFBP38117 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ETFBP38117 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ETFBP38117 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ETFBP38117 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ETFBP38117 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ETFBP38117 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ETFBP38117 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ETFBP38117 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ETFBP38117 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ETFBP38117 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ETFBP38117 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ETFBP38117 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ETFBP38117 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ETFBP38117 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ETFBP38117 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ETFBP38117 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ETFBP38117 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ETFBP38117 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ETFBP38117 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ETFBP38117 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ETFBP38117 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ETFBP38117 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms